Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG5

PARD6B, Partitioning defective 6 homolog beta, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARD6BQ9BYG5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PARD6BQ9BYG5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PARD6BQ9BYG5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PARD6BQ9BYG5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PARD6BQ9BYG5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PARD6BQ9BYG5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PARD6BQ9BYG5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PARD6BQ9BYG5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PARD6BQ9BYG5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PARD6BQ9BYG5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PARD6BQ9BYG5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PARD6BQ9BYG5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PARD6BQ9BYG5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PARD6BQ9BYG5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PARD6BQ9BYG5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PARD6BQ9BYG5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PARD6BQ9BYG5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PARD6BQ9BYG5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PARD6BQ9BYG5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PARD6BQ9BYG5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PARD6BQ9BYG5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PARD6BQ9BYG5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PARD6BQ9BYG5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PARD6BQ9BYG5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PARD6BQ9BYG5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PARD6BQ9BYG5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PARD6BQ9BYG5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PARD6BQ9BYG5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PARD6BQ9BYG5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PARD6BQ9BYG5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PARD6BQ9BYG5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PARD6BQ9BYG5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PARD6BQ9BYG5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PARD6BQ9BYG5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PARD6BQ9BYG5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PARD6BQ9BYG5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PARD6BQ9BYG5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PARD6BQ9BYG5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PARD6BQ9BYG5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PARD6BQ9BYG5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PARD6BQ9BYG5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PARD6BQ9BYG5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PARD6BQ9BYG5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PARD6BQ9BYG5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PARD6BQ9BYG5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PARD6BQ9BYG5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PARD6BQ9BYG5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PARD6BQ9BYG5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PARD6BQ9BYG5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PARD6BQ9BYG5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PARD6BQ9BYG5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PARD6BQ9BYG5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PARD6BQ9BYG5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PARD6BQ9BYG5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PARD6BQ9BYG5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PARD6BQ9BYG5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PARD6BQ9BYG5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PARD6BQ9BYG5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PARD6BQ9BYG5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PARD6BQ9BYG5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PARD6BQ9BYG5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PARD6BQ9BYG5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PARD6BQ9BYG5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PARD6BQ9BYG5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PARD6BQ9BYG5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PARD6BQ9BYG5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PARD6BQ9BYG5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PARD6BQ9BYG5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PARD6BQ9BYG5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PARD6BQ9BYG5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PARD6BQ9BYG5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PARD6BQ9BYG5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PARD6BQ9BYG5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PARD6BQ9BYG5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PARD6BQ9BYG5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PARD6BQ9BYG5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PARD6BQ9BYG5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PARD6BQ9BYG5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PARD6BQ9BYG5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PARD6BQ9BYG5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PARD6BQ9BYG5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PARD6BQ9BYG5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PARD6BQ9BYG5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PARD6BQ9BYG5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PARD6BQ9BYG5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PARD6BQ9BYG5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PARD6BQ9BYG5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PARD6BQ9BYG5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PARD6BQ9BYG5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PARD6BQ9BYG5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PARD6BQ9BYG5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PARD6BQ9BYG5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PARD6BQ9BYG5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PARD6BQ9BYG5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PARD6BQ9BYG5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PARD6BQ9BYG5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PARD6BQ9BYG5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PARD6BQ9BYG5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PARD6BQ9BYG5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PARD6BQ9BYG5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms