Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ1

C1QTNF1, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF1Q9BXJ1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
C1QTNF1Q9BXJ1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
C1QTNF1Q9BXJ1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
C1QTNF1Q9BXJ1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
C1QTNF1Q9BXJ1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
C1QTNF1Q9BXJ1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
C1QTNF1Q9BXJ1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
C1QTNF1Q9BXJ1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
C1QTNF1Q9BXJ1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
C1QTNF1Q9BXJ1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
C1QTNF1Q9BXJ1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
C1QTNF1Q9BXJ1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
C1QTNF1Q9BXJ1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C1QTNF1Q9BXJ1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C1QTNF1Q9BXJ1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
C1QTNF1Q9BXJ1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
C1QTNF1Q9BXJ1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
C1QTNF1Q9BXJ1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
C1QTNF1Q9BXJ1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
C1QTNF1Q9BXJ1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
C1QTNF1Q9BXJ1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
C1QTNF1Q9BXJ1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
C1QTNF1Q9BXJ1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
C1QTNF1Q9BXJ1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
C1QTNF1Q9BXJ1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
C1QTNF1Q9BXJ1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
C1QTNF1Q9BXJ1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
C1QTNF1Q9BXJ1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
C1QTNF1Q9BXJ1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C1QTNF1Q9BXJ1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
C1QTNF1Q9BXJ1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C1QTNF1Q9BXJ1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C1QTNF1Q9BXJ1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
C1QTNF1Q9BXJ1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
C1QTNF1Q9BXJ1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
C1QTNF1Q9BXJ1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
C1QTNF1Q9BXJ1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
C1QTNF1Q9BXJ1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
C1QTNF1Q9BXJ1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
C1QTNF1Q9BXJ1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
C1QTNF1Q9BXJ1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
C1QTNF1Q9BXJ1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
C1QTNF1Q9BXJ1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
C1QTNF1Q9BXJ1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
C1QTNF1Q9BXJ1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
C1QTNF1Q9BXJ1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
C1QTNF1Q9BXJ1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
C1QTNF1Q9BXJ1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
C1QTNF1Q9BXJ1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
C1QTNF1Q9BXJ1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
C1QTNF1Q9BXJ1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
C1QTNF1Q9BXJ1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
C1QTNF1Q9BXJ1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
C1QTNF1Q9BXJ1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
C1QTNF1Q9BXJ1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
C1QTNF1Q9BXJ1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
C1QTNF1Q9BXJ1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
C1QTNF1Q9BXJ1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
C1QTNF1Q9BXJ1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
C1QTNF1Q9BXJ1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
C1QTNF1Q9BXJ1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
C1QTNF1Q9BXJ1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
C1QTNF1Q9BXJ1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
C1QTNF1Q9BXJ1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
C1QTNF1Q9BXJ1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
C1QTNF1Q9BXJ1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
C1QTNF1Q9BXJ1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
C1QTNF1Q9BXJ1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
C1QTNF1Q9BXJ1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
C1QTNF1Q9BXJ1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
C1QTNF1Q9BXJ1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
C1QTNF1Q9BXJ1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
C1QTNF1Q9BXJ1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
C1QTNF1Q9BXJ1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
C1QTNF1Q9BXJ1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
C1QTNF1Q9BXJ1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
C1QTNF1Q9BXJ1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
C1QTNF1Q9BXJ1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
C1QTNF1Q9BXJ1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
C1QTNF1Q9BXJ1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
C1QTNF1Q9BXJ1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
C1QTNF1Q9BXJ1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
C1QTNF1Q9BXJ1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
C1QTNF1Q9BXJ1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
C1QTNF1Q9BXJ1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
C1QTNF1Q9BXJ1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
C1QTNF1Q9BXJ1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
C1QTNF1Q9BXJ1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
C1QTNF1Q9BXJ1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
C1QTNF1Q9BXJ1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
C1QTNF1Q9BXJ1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
C1QTNF1Q9BXJ1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
C1QTNF1Q9BXJ1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
C1QTNF1Q9BXJ1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
C1QTNF1Q9BXJ1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
C1QTNF1Q9BXJ1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
C1QTNF1Q9BXJ1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
C1QTNF1Q9BXJ1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
C1QTNF1Q9BXJ1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
C1QTNF1Q9BXJ1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms