Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PLVAPQ9BX97 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PLVAPQ9BX97 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PLVAPQ9BX97 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PLVAPQ9BX97 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PLVAPQ9BX97 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PLVAPQ9BX97 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PLVAPQ9BX97 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PLVAPQ9BX97 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PLVAPQ9BX97 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PLVAPQ9BX97 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PLVAPQ9BX97 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PLVAPQ9BX97 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PLVAPQ9BX97 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PLVAPQ9BX97 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PLVAPQ9BX97 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PLVAPQ9BX97 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PLVAPQ9BX97 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PLVAPQ9BX97 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PLVAPQ9BX97 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PLVAPQ9BX97 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PLVAPQ9BX97 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PLVAPQ9BX97 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PLVAPQ9BX97 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PLVAPQ9BX97 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PLVAPQ9BX97 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PLVAPQ9BX97 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PLVAPQ9BX97 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PLVAPQ9BX97 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PLVAPQ9BX97 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PLVAPQ9BX97 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PLVAPQ9BX97 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PLVAPQ9BX97 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PLVAPQ9BX97 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PLVAPQ9BX97 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PLVAPQ9BX97 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PLVAPQ9BX97 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PLVAPQ9BX97 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PLVAPQ9BX97 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PLVAPQ9BX97 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PLVAPQ9BX97 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PLVAPQ9BX97 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PLVAPQ9BX97 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PLVAPQ9BX97 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PLVAPQ9BX97 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PLVAPQ9BX97 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PLVAPQ9BX97 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PLVAPQ9BX97 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PLVAPQ9BX97 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PLVAPQ9BX97 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PLVAPQ9BX97 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PLVAPQ9BX97 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PLVAPQ9BX97 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PLVAPQ9BX97 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PLVAPQ9BX97 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLVAPQ9BX97 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLVAPQ9BX97 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PLVAPQ9BX97 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PLVAPQ9BX97 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PLVAPQ9BX97 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PLVAPQ9BX97 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PLVAPQ9BX97 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PLVAPQ9BX97 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PLVAPQ9BX97 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PLVAPQ9BX97 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PLVAPQ9BX97 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PLVAPQ9BX97 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PLVAPQ9BX97 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PLVAPQ9BX97 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PLVAPQ9BX97 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.08
PLVAPQ9BX97 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PLVAPQ9BX97 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PLVAPQ9BX97 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PLVAPQ9BX97 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PLVAPQ9BX97 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PLVAPQ9BX97 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PLVAPQ9BX97 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PLVAPQ9BX97 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PLVAPQ9BX97 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PLVAPQ9BX97 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PLVAPQ9BX97 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PLVAPQ9BX97 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PLVAPQ9BX97 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PLVAPQ9BX97 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PLVAPQ9BX97 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PLVAPQ9BX97 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PLVAPQ9BX97 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PLVAPQ9BX97 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PLVAPQ9BX97 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PLVAPQ9BX97 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PLVAPQ9BX97 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PLVAPQ9BX97 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PLVAPQ9BX97 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PLVAPQ9BX97 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PLVAPQ9BX97 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PLVAPQ9BX97 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PLVAPQ9BX97 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PLVAPQ9BX97 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PLVAPQ9BX97 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PLVAPQ9BX97 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms