Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL4

SELENOO, Selenoprotein O, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOOQ9BVL4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SELENOOQ9BVL4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SELENOOQ9BVL4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SELENOOQ9BVL4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SELENOOQ9BVL4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SELENOOQ9BVL4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SELENOOQ9BVL4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SELENOOQ9BVL4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SELENOOQ9BVL4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SELENOOQ9BVL4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SELENOOQ9BVL4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SELENOOQ9BVL4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SELENOOQ9BVL4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SELENOOQ9BVL4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SELENOOQ9BVL4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SELENOOQ9BVL4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SELENOOQ9BVL4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SELENOOQ9BVL4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SELENOOQ9BVL4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SELENOOQ9BVL4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SELENOOQ9BVL4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SELENOOQ9BVL4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SELENOOQ9BVL4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SELENOOQ9BVL4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SELENOOQ9BVL4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SELENOOQ9BVL4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SELENOOQ9BVL4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SELENOOQ9BVL4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SELENOOQ9BVL4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SELENOOQ9BVL4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SELENOOQ9BVL4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SELENOOQ9BVL4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SELENOOQ9BVL4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
SELENOOQ9BVL4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SELENOOQ9BVL4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SELENOOQ9BVL4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SELENOOQ9BVL4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SELENOOQ9BVL4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SELENOOQ9BVL4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SELENOOQ9BVL4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SELENOOQ9BVL4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SELENOOQ9BVL4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SELENOOQ9BVL4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SELENOOQ9BVL4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SELENOOQ9BVL4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SELENOOQ9BVL4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SELENOOQ9BVL4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SELENOOQ9BVL4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SELENOOQ9BVL4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SELENOOQ9BVL4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SELENOOQ9BVL4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SELENOOQ9BVL4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SELENOOQ9BVL4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SELENOOQ9BVL4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SELENOOQ9BVL4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SELENOOQ9BVL4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SELENOOQ9BVL4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SELENOOQ9BVL4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SELENOOQ9BVL4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SELENOOQ9BVL4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SELENOOQ9BVL4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SELENOOQ9BVL4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SELENOOQ9BVL4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SELENOOQ9BVL4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SELENOOQ9BVL4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SELENOOQ9BVL4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SELENOOQ9BVL4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SELENOOQ9BVL4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SELENOOQ9BVL4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SELENOOQ9BVL4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SELENOOQ9BVL4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SELENOOQ9BVL4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SELENOOQ9BVL4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SELENOOQ9BVL4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SELENOOQ9BVL4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SELENOOQ9BVL4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SELENOOQ9BVL4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SELENOOQ9BVL4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SELENOOQ9BVL4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SELENOOQ9BVL4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SELENOOQ9BVL4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
SELENOOQ9BVL4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SELENOOQ9BVL4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SELENOOQ9BVL4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SELENOOQ9BVL4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SELENOOQ9BVL4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SELENOOQ9BVL4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SELENOOQ9BVL4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SELENOOQ9BVL4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SELENOOQ9BVL4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SELENOOQ9BVL4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SELENOOQ9BVL4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SELENOOQ9BVL4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SELENOOQ9BVL4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SELENOOQ9BVL4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SELENOOQ9BVL4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SELENOOQ9BVL4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SELENOOQ9BVL4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SELENOOQ9BVL4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SELENOOQ9BVL4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms