Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV99

LRRC61, Leucine-rich repeat-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC61Q9BV99 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC61Q9BV99 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC61Q9BV99 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC61Q9BV99 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC61Q9BV99 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC61Q9BV99 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC61Q9BV99 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC61Q9BV99 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC61Q9BV99 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC61Q9BV99 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC61Q9BV99 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC61Q9BV99 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC61Q9BV99 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC61Q9BV99 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC61Q9BV99 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC61Q9BV99 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC61Q9BV99 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC61Q9BV99 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC61Q9BV99 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC61Q9BV99 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC61Q9BV99 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC61Q9BV99 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC61Q9BV99 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC61Q9BV99 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC61Q9BV99 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC61Q9BV99 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC61Q9BV99 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC61Q9BV99 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC61Q9BV99 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC61Q9BV99 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC61Q9BV99 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC61Q9BV99 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC61Q9BV99 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC61Q9BV99 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC61Q9BV99 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC61Q9BV99 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC61Q9BV99 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC61Q9BV99 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC61Q9BV99 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC61Q9BV99 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC61Q9BV99 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRC61Q9BV99 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC61Q9BV99 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC61Q9BV99 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC61Q9BV99 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC61Q9BV99 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC61Q9BV99 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC61Q9BV99 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC61Q9BV99 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC61Q9BV99 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC61Q9BV99 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC61Q9BV99 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC61Q9BV99 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC61Q9BV99 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC61Q9BV99 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC61Q9BV99 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC61Q9BV99 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC61Q9BV99 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC61Q9BV99 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC61Q9BV99 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC61Q9BV99 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC61Q9BV99 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC61Q9BV99 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC61Q9BV99 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC61Q9BV99 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC61Q9BV99 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC61Q9BV99 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC61Q9BV99 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LRRC61Q9BV99 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC61Q9BV99 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC61Q9BV99 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC61Q9BV99 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC61Q9BV99 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC61Q9BV99 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC61Q9BV99 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC61Q9BV99 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC61Q9BV99 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC61Q9BV99 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC61Q9BV99 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC61Q9BV99 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC61Q9BV99 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC61Q9BV99 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC61Q9BV99 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC61Q9BV99 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC61Q9BV99 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC61Q9BV99 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC61Q9BV99 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC61Q9BV99 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC61Q9BV99 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC61Q9BV99 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC61Q9BV99 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC61Q9BV99 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC61Q9BV99 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC61Q9BV99 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC61Q9BV99 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC61Q9BV99 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC61Q9BV99 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC61Q9BV99 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC61Q9BV99 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC61Q9BV99 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms