Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV35

SLC25A23, Calcium-binding mitochondrial carrier protein SCaMC-3, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A23Q9BV35 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC25A23Q9BV35 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC25A23Q9BV35 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC25A23Q9BV35 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC25A23Q9BV35 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC25A23Q9BV35 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC25A23Q9BV35 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC25A23Q9BV35 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC25A23Q9BV35 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC25A23Q9BV35 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC25A23Q9BV35 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC25A23Q9BV35 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC25A23Q9BV35 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC25A23Q9BV35 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC25A23Q9BV35 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC25A23Q9BV35 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC25A23Q9BV35 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC25A23Q9BV35 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC25A23Q9BV35 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC25A23Q9BV35 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC25A23Q9BV35 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC25A23Q9BV35 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC25A23Q9BV35 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC25A23Q9BV35 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC25A23Q9BV35 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC25A23Q9BV35 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC25A23Q9BV35 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC25A23Q9BV35 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC25A23Q9BV35 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC25A23Q9BV35 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC25A23Q9BV35 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC25A23Q9BV35 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC25A23Q9BV35 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC25A23Q9BV35 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC25A23Q9BV35 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC25A23Q9BV35 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC25A23Q9BV35 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC25A23Q9BV35 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC25A23Q9BV35 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC25A23Q9BV35 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC25A23Q9BV35 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC25A23Q9BV35 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC25A23Q9BV35 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC25A23Q9BV35 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC25A23Q9BV35 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC25A23Q9BV35 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC25A23Q9BV35 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC25A23Q9BV35 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC25A23Q9BV35 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC25A23Q9BV35 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC25A23Q9BV35 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC25A23Q9BV35 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC25A23Q9BV35 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC25A23Q9BV35 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC25A23Q9BV35 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC25A23Q9BV35 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC25A23Q9BV35 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC25A23Q9BV35 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC25A23Q9BV35 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC25A23Q9BV35 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC25A23Q9BV35 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC25A23Q9BV35 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC25A23Q9BV35 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC25A23Q9BV35 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC25A23Q9BV35 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC25A23Q9BV35 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC25A23Q9BV35 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC25A23Q9BV35 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC25A23Q9BV35 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC25A23Q9BV35 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC25A23Q9BV35 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC25A23Q9BV35 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC25A23Q9BV35 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC25A23Q9BV35 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC25A23Q9BV35 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC25A23Q9BV35 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC25A23Q9BV35 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC25A23Q9BV35 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC25A23Q9BV35 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC25A23Q9BV35 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC25A23Q9BV35 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC25A23Q9BV35 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC25A23Q9BV35 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC25A23Q9BV35 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC25A23Q9BV35 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC25A23Q9BV35 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC25A23Q9BV35 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC25A23Q9BV35 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC25A23Q9BV35 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC25A23Q9BV35 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC25A23Q9BV35 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC25A23Q9BV35 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC25A23Q9BV35 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC25A23Q9BV35 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC25A23Q9BV35 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC25A23Q9BV35 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC25A23Q9BV35 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC25A23Q9BV35 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC25A23Q9BV35 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC25A23Q9BV35 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms