Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSQ5

CCM2, Cerebral cavernous malformations 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2Q9BSQ5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCM2Q9BSQ5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCM2Q9BSQ5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCM2Q9BSQ5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCM2Q9BSQ5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCM2Q9BSQ5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCM2Q9BSQ5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCM2Q9BSQ5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCM2Q9BSQ5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCM2Q9BSQ5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCM2Q9BSQ5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCM2Q9BSQ5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCM2Q9BSQ5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCM2Q9BSQ5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCM2Q9BSQ5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCM2Q9BSQ5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCM2Q9BSQ5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCM2Q9BSQ5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCM2Q9BSQ5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCM2Q9BSQ5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCM2Q9BSQ5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCM2Q9BSQ5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCM2Q9BSQ5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCM2Q9BSQ5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCM2Q9BSQ5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCM2Q9BSQ5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCM2Q9BSQ5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCM2Q9BSQ5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCM2Q9BSQ5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCM2Q9BSQ5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCM2Q9BSQ5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCM2Q9BSQ5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCM2Q9BSQ5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCM2Q9BSQ5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCM2Q9BSQ5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCM2Q9BSQ5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCM2Q9BSQ5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCM2Q9BSQ5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCM2Q9BSQ5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCM2Q9BSQ5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCM2Q9BSQ5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCM2Q9BSQ5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCM2Q9BSQ5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCM2Q9BSQ5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCM2Q9BSQ5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCM2Q9BSQ5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCM2Q9BSQ5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCM2Q9BSQ5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCM2Q9BSQ5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCM2Q9BSQ5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCM2Q9BSQ5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCM2Q9BSQ5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCM2Q9BSQ5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCM2Q9BSQ5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCM2Q9BSQ5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCM2Q9BSQ5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCM2Q9BSQ5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCM2Q9BSQ5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCM2Q9BSQ5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCM2Q9BSQ5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCM2Q9BSQ5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCM2Q9BSQ5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCM2Q9BSQ5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCM2Q9BSQ5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCM2Q9BSQ5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCM2Q9BSQ5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCM2Q9BSQ5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCM2Q9BSQ5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCM2Q9BSQ5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCM2Q9BSQ5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCM2Q9BSQ5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCM2Q9BSQ5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCM2Q9BSQ5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCM2Q9BSQ5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCM2Q9BSQ5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCM2Q9BSQ5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCM2Q9BSQ5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCM2Q9BSQ5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCM2Q9BSQ5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCM2Q9BSQ5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCM2Q9BSQ5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCM2Q9BSQ5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCM2Q9BSQ5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCM2Q9BSQ5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCM2Q9BSQ5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCM2Q9BSQ5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCM2Q9BSQ5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCM2Q9BSQ5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCM2Q9BSQ5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCM2Q9BSQ5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCM2Q9BSQ5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCM2Q9BSQ5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCM2Q9BSQ5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCM2Q9BSQ5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCM2Q9BSQ5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCM2Q9BSQ5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCM2Q9BSQ5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCM2Q9BSQ5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCM2Q9BSQ5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCM2Q9BSQ5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms