Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQL6

FERMT1, Fermitin family homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FERMT1Q9BQL6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FERMT1Q9BQL6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FERMT1Q9BQL6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FERMT1Q9BQL6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
FERMT1Q9BQL6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
FERMT1Q9BQL6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
FERMT1Q9BQL6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FERMT1Q9BQL6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FERMT1Q9BQL6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FERMT1Q9BQL6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FERMT1Q9BQL6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FERMT1Q9BQL6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FERMT1Q9BQL6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FERMT1Q9BQL6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FERMT1Q9BQL6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FERMT1Q9BQL6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FERMT1Q9BQL6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FERMT1Q9BQL6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FERMT1Q9BQL6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FERMT1Q9BQL6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FERMT1Q9BQL6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
FERMT1Q9BQL6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FERMT1Q9BQL6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FERMT1Q9BQL6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FERMT1Q9BQL6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FERMT1Q9BQL6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FERMT1Q9BQL6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FERMT1Q9BQL6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FERMT1Q9BQL6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FERMT1Q9BQL6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FERMT1Q9BQL6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FERMT1Q9BQL6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FERMT1Q9BQL6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FERMT1Q9BQL6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FERMT1Q9BQL6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
FERMT1Q9BQL6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FERMT1Q9BQL6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FERMT1Q9BQL6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FERMT1Q9BQL6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FERMT1Q9BQL6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FERMT1Q9BQL6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FERMT1Q9BQL6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FERMT1Q9BQL6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
FERMT1Q9BQL6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FERMT1Q9BQL6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FERMT1Q9BQL6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FERMT1Q9BQL6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FERMT1Q9BQL6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FERMT1Q9BQL6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FERMT1Q9BQL6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
FERMT1Q9BQL6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
FERMT1Q9BQL6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FERMT1Q9BQL6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FERMT1Q9BQL6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FERMT1Q9BQL6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FERMT1Q9BQL6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FERMT1Q9BQL6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FERMT1Q9BQL6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FERMT1Q9BQL6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FERMT1Q9BQL6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FERMT1Q9BQL6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FERMT1Q9BQL6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FERMT1Q9BQL6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FERMT1Q9BQL6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
FERMT1Q9BQL6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
FERMT1Q9BQL6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FERMT1Q9BQL6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FERMT1Q9BQL6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FERMT1Q9BQL6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FERMT1Q9BQL6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FERMT1Q9BQL6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FERMT1Q9BQL6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FERMT1Q9BQL6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FERMT1Q9BQL6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FERMT1Q9BQL6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FERMT1Q9BQL6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FERMT1Q9BQL6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FERMT1Q9BQL6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FERMT1Q9BQL6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FERMT1Q9BQL6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FERMT1Q9BQL6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
FERMT1Q9BQL6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FERMT1Q9BQL6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FERMT1Q9BQL6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FERMT1Q9BQL6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FERMT1Q9BQL6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FERMT1Q9BQL6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FERMT1Q9BQL6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
FERMT1Q9BQL6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
FERMT1Q9BQL6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FERMT1Q9BQL6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FERMT1Q9BQL6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FERMT1Q9BQL6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FERMT1Q9BQL6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
FERMT1Q9BQL6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FERMT1Q9BQL6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FERMT1Q9BQL6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
FERMT1Q9BQL6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FERMT1Q9BQL6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FERMT1Q9BQL6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms