Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ83

SLX1A, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX1AQ9BQ83 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLX1AQ9BQ83 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLX1AQ9BQ83 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLX1AQ9BQ83 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLX1AQ9BQ83 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLX1AQ9BQ83 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLX1AQ9BQ83 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLX1AQ9BQ83 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLX1AQ9BQ83 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLX1AQ9BQ83 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLX1AQ9BQ83 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLX1AQ9BQ83 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLX1AQ9BQ83 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLX1AQ9BQ83 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLX1AQ9BQ83 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLX1AQ9BQ83 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLX1AQ9BQ83 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLX1AQ9BQ83 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SLX1AQ9BQ83 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLX1AQ9BQ83 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLX1AQ9BQ83 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLX1AQ9BQ83 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLX1AQ9BQ83 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLX1AQ9BQ83 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLX1AQ9BQ83 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLX1AQ9BQ83 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLX1AQ9BQ83 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLX1AQ9BQ83 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLX1AQ9BQ83 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLX1AQ9BQ83 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLX1AQ9BQ83 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLX1AQ9BQ83 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLX1AQ9BQ83 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLX1AQ9BQ83 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLX1AQ9BQ83 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLX1AQ9BQ83 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLX1AQ9BQ83 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLX1AQ9BQ83 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLX1AQ9BQ83 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLX1AQ9BQ83 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLX1AQ9BQ83 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLX1AQ9BQ83 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLX1AQ9BQ83 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLX1AQ9BQ83 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLX1AQ9BQ83 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLX1AQ9BQ83 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLX1AQ9BQ83 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLX1AQ9BQ83 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLX1AQ9BQ83 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLX1AQ9BQ83 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLX1AQ9BQ83 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLX1AQ9BQ83 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLX1AQ9BQ83 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLX1AQ9BQ83 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLX1AQ9BQ83 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLX1AQ9BQ83 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLX1AQ9BQ83 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLX1AQ9BQ83 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLX1AQ9BQ83 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLX1AQ9BQ83 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLX1AQ9BQ83 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLX1AQ9BQ83 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLX1AQ9BQ83 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLX1AQ9BQ83 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLX1AQ9BQ83 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLX1AQ9BQ83 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLX1AQ9BQ83 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLX1AQ9BQ83 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLX1AQ9BQ83 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLX1AQ9BQ83 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLX1AQ9BQ83 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLX1AQ9BQ83 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLX1AQ9BQ83 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLX1AQ9BQ83 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLX1AQ9BQ83 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SLX1AQ9BQ83 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLX1AQ9BQ83 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLX1AQ9BQ83 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLX1AQ9BQ83 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLX1AQ9BQ83 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLX1AQ9BQ83 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLX1AQ9BQ83 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLX1AQ9BQ83 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLX1AQ9BQ83 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLX1AQ9BQ83 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLX1AQ9BQ83 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLX1AQ9BQ83 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLX1AQ9BQ83 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLX1AQ9BQ83 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLX1AQ9BQ83 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLX1AQ9BQ83 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLX1AQ9BQ83 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLX1AQ9BQ83 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLX1AQ9BQ83 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLX1AQ9BQ83 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLX1AQ9BQ83 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLX1AQ9BQ83 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLX1AQ9BQ83 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLX1AQ9BQ83 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLX1AQ9BQ83 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms