Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NIPSNAP1Q9BPW8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NIPSNAP1Q9BPW8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NIPSNAP1Q9BPW8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NIPSNAP1Q9BPW8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NIPSNAP1Q9BPW8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NIPSNAP1Q9BPW8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NIPSNAP1Q9BPW8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NIPSNAP1Q9BPW8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NIPSNAP1Q9BPW8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NIPSNAP1Q9BPW8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NIPSNAP1Q9BPW8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NIPSNAP1Q9BPW8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NIPSNAP1Q9BPW8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NIPSNAP1Q9BPW8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NIPSNAP1Q9BPW8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NIPSNAP1Q9BPW8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NIPSNAP1Q9BPW8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NIPSNAP1Q9BPW8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NIPSNAP1Q9BPW8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NIPSNAP1Q9BPW8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NIPSNAP1Q9BPW8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NIPSNAP1Q9BPW8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NIPSNAP1Q9BPW8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NIPSNAP1Q9BPW8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NIPSNAP1Q9BPW8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NIPSNAP1Q9BPW8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIPSNAP1Q9BPW8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIPSNAP1Q9BPW8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIPSNAP1Q9BPW8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIPSNAP1Q9BPW8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NIPSNAP1Q9BPW8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NIPSNAP1Q9BPW8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NIPSNAP1Q9BPW8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NIPSNAP1Q9BPW8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NIPSNAP1Q9BPW8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NIPSNAP1Q9BPW8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NIPSNAP1Q9BPW8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NIPSNAP1Q9BPW8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NIPSNAP1Q9BPW8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NIPSNAP1Q9BPW8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NIPSNAP1Q9BPW8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NIPSNAP1Q9BPW8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NIPSNAP1Q9BPW8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NIPSNAP1Q9BPW8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NIPSNAP1Q9BPW8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NIPSNAP1Q9BPW8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NIPSNAP1Q9BPW8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NIPSNAP1Q9BPW8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NIPSNAP1Q9BPW8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NIPSNAP1Q9BPW8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NIPSNAP1Q9BPW8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NIPSNAP1Q9BPW8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NIPSNAP1Q9BPW8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NIPSNAP1Q9BPW8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NIPSNAP1Q9BPW8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NIPSNAP1Q9BPW8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NIPSNAP1Q9BPW8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NIPSNAP1Q9BPW8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NIPSNAP1Q9BPW8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NIPSNAP1Q9BPW8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NIPSNAP1Q9BPW8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NIPSNAP1Q9BPW8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NIPSNAP1Q9BPW8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NIPSNAP1Q9BPW8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NIPSNAP1Q9BPW8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NIPSNAP1Q9BPW8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NIPSNAP1Q9BPW8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NIPSNAP1Q9BPW8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NIPSNAP1Q9BPW8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NIPSNAP1Q9BPW8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NIPSNAP1Q9BPW8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NIPSNAP1Q9BPW8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NIPSNAP1Q9BPW8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NIPSNAP1Q9BPW8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NIPSNAP1Q9BPW8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NIPSNAP1Q9BPW8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NIPSNAP1Q9BPW8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NIPSNAP1Q9BPW8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIPSNAP1Q9BPW8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIPSNAP1Q9BPW8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIPSNAP1Q9BPW8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIPSNAP1Q9BPW8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NIPSNAP1Q9BPW8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NIPSNAP1Q9BPW8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NIPSNAP1Q9BPW8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NIPSNAP1Q9BPW8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NIPSNAP1Q9BPW8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NIPSNAP1Q9BPW8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NIPSNAP1Q9BPW8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NIPSNAP1Q9BPW8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NIPSNAP1Q9BPW8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NIPSNAP1Q9BPW8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NIPSNAP1Q9BPW8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NIPSNAP1Q9BPW8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NIPSNAP1Q9BPW8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms