Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ARID3AQ99856 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARID3AQ99856 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARID3AQ99856 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARID3AQ99856 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARID3AQ99856 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARID3AQ99856 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARID3AQ99856 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARID3AQ99856 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARID3AQ99856 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ARID3AQ99856 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARID3AQ99856 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
ARID3AQ99856 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ARID3AQ99856 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARID3AQ99856 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARID3AQ99856 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARID3AQ99856 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARID3AQ99856 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARID3AQ99856 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARID3AQ99856 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARID3AQ99856 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARID3AQ99856 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARID3AQ99856 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARID3AQ99856 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARID3AQ99856 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARID3AQ99856 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARID3AQ99856 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARID3AQ99856 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARID3AQ99856 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARID3AQ99856 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARID3AQ99856 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARID3AQ99856 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARID3AQ99856 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARID3AQ99856 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARID3AQ99856 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARID3AQ99856 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARID3AQ99856 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARID3AQ99856 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARID3AQ99856 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARID3AQ99856 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARID3AQ99856 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARID3AQ99856 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARID3AQ99856 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARID3AQ99856 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARID3AQ99856 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARID3AQ99856 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARID3AQ99856 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ARID3AQ99856 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARID3AQ99856 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARID3AQ99856 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARID3AQ99856 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARID3AQ99856 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARID3AQ99856 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ARID3AQ99856 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARID3AQ99856 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARID3AQ99856 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ARID3AQ99856 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARID3AQ99856 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARID3AQ99856 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ARID3AQ99856 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ARID3AQ99856 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ARID3AQ99856 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARID3AQ99856 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARID3AQ99856 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARID3AQ99856 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARID3AQ99856 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARID3AQ99856 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARID3AQ99856 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARID3AQ99856 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARID3AQ99856 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARID3AQ99856 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARID3AQ99856 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARID3AQ99856 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARID3AQ99856 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARID3AQ99856 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARID3AQ99856 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARID3AQ99856 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARID3AQ99856 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARID3AQ99856 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARID3AQ99856 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARID3AQ99856 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARID3AQ99856 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ARID3AQ99856 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARID3AQ99856 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARID3AQ99856 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARID3AQ99856 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARID3AQ99856 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARID3AQ99856 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARID3AQ99856 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARID3AQ99856 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARID3AQ99856 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARID3AQ99856 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARID3AQ99856 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARID3AQ99856 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARID3AQ99856 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ARID3AQ99856 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARID3AQ99856 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARID3AQ99856 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARID3AQ99856 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARID3AQ99856 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms