Protein–RNA interactions for Protein: Q99612

KLF6, Krueppel-like factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF6Q99612 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KLF6Q99612 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KLF6Q99612 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KLF6Q99612 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KLF6Q99612 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KLF6Q99612 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KLF6Q99612 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KLF6Q99612 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KLF6Q99612 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KLF6Q99612 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KLF6Q99612 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KLF6Q99612 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KLF6Q99612 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLF6Q99612 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KLF6Q99612 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KLF6Q99612 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KLF6Q99612 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KLF6Q99612 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KLF6Q99612 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KLF6Q99612 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KLF6Q99612 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLF6Q99612 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
KLF6Q99612 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLF6Q99612 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLF6Q99612 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLF6Q99612 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLF6Q99612 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLF6Q99612 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLF6Q99612 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLF6Q99612 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLF6Q99612 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLF6Q99612 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLF6Q99612 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLF6Q99612 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLF6Q99612 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLF6Q99612 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KLF6Q99612 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KLF6Q99612 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KLF6Q99612 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLF6Q99612 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLF6Q99612 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLF6Q99612 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLF6Q99612 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLF6Q99612 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLF6Q99612 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLF6Q99612 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLF6Q99612 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLF6Q99612 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLF6Q99612 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLF6Q99612 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLF6Q99612 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
KLF6Q99612 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLF6Q99612 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLF6Q99612 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLF6Q99612 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLF6Q99612 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLF6Q99612 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLF6Q99612 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLF6Q99612 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLF6Q99612 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLF6Q99612 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLF6Q99612 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
KLF6Q99612 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLF6Q99612 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLF6Q99612 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLF6Q99612 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLF6Q99612 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
KLF6Q99612 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLF6Q99612 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLF6Q99612 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLF6Q99612 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLF6Q99612 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KLF6Q99612 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KLF6Q99612 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KLF6Q99612 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KLF6Q99612 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KLF6Q99612 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KLF6Q99612 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KLF6Q99612 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
KLF6Q99612 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KLF6Q99612 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KLF6Q99612 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KLF6Q99612 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KLF6Q99612 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KLF6Q99612 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
KLF6Q99612 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
KLF6Q99612 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
KLF6Q99612 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KLF6Q99612 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KLF6Q99612 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KLF6Q99612 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KLF6Q99612 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KLF6Q99612 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
KLF6Q99612 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
KLF6Q99612 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
KLF6Q99612 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KLF6Q99612 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KLF6Q99612 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KLF6Q99612 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KLF6Q99612 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.5 ms