Protein–RNA interactions for Protein: Q96T58

SPEN, Msx2-interacting protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPENQ96T58 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPENQ96T58 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPENQ96T58 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPENQ96T58 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPENQ96T58 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPENQ96T58 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPENQ96T58 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPENQ96T58 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPENQ96T58 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPENQ96T58 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPENQ96T58 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPENQ96T58 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPENQ96T58 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPENQ96T58 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SPENQ96T58 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SPENQ96T58 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPENQ96T58 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPENQ96T58 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPENQ96T58 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPENQ96T58 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SPENQ96T58 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPENQ96T58 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPENQ96T58 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPENQ96T58 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SPENQ96T58 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SPENQ96T58 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPENQ96T58 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPENQ96T58 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SPENQ96T58 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPENQ96T58 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPENQ96T58 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPENQ96T58 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPENQ96T58 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPENQ96T58 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SPENQ96T58 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPENQ96T58 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPENQ96T58 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPENQ96T58 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPENQ96T58 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPENQ96T58 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPENQ96T58 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPENQ96T58 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPENQ96T58 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPENQ96T58 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SPENQ96T58 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SPENQ96T58 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPENQ96T58 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPENQ96T58 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPENQ96T58 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPENQ96T58 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPENQ96T58 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPENQ96T58 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPENQ96T58 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPENQ96T58 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPENQ96T58 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPENQ96T58 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPENQ96T58 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPENQ96T58 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SPENQ96T58 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPENQ96T58 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SPENQ96T58 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPENQ96T58 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SPENQ96T58 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPENQ96T58 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPENQ96T58 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPENQ96T58 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPENQ96T58 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SPENQ96T58 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPENQ96T58 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPENQ96T58 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPENQ96T58 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPENQ96T58 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPENQ96T58 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SPENQ96T58 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPENQ96T58 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPENQ96T58 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPENQ96T58 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SPENQ96T58 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPENQ96T58 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPENQ96T58 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPENQ96T58 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPENQ96T58 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPENQ96T58 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPENQ96T58 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPENQ96T58 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPENQ96T58 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPENQ96T58 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPENQ96T58 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPENQ96T58 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPENQ96T58 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPENQ96T58 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPENQ96T58 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SPENQ96T58 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPENQ96T58 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPENQ96T58 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SPENQ96T58 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPENQ96T58 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPENQ96T58 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPENQ96T58 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPENQ96T58 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms