Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUDCD1Q96RS6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUDCD1Q96RS6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUDCD1Q96RS6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NUDCD1Q96RS6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NUDCD1Q96RS6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NUDCD1Q96RS6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NUDCD1Q96RS6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NUDCD1Q96RS6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NUDCD1Q96RS6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NUDCD1Q96RS6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUDCD1Q96RS6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUDCD1Q96RS6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUDCD1Q96RS6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUDCD1Q96RS6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUDCD1Q96RS6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUDCD1Q96RS6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUDCD1Q96RS6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUDCD1Q96RS6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUDCD1Q96RS6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUDCD1Q96RS6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUDCD1Q96RS6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUDCD1Q96RS6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUDCD1Q96RS6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUDCD1Q96RS6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUDCD1Q96RS6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUDCD1Q96RS6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUDCD1Q96RS6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NUDCD1Q96RS6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUDCD1Q96RS6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUDCD1Q96RS6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUDCD1Q96RS6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUDCD1Q96RS6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUDCD1Q96RS6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUDCD1Q96RS6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUDCD1Q96RS6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NUDCD1Q96RS6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUDCD1Q96RS6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUDCD1Q96RS6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUDCD1Q96RS6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUDCD1Q96RS6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUDCD1Q96RS6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUDCD1Q96RS6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NUDCD1Q96RS6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUDCD1Q96RS6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUDCD1Q96RS6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUDCD1Q96RS6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUDCD1Q96RS6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUDCD1Q96RS6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUDCD1Q96RS6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUDCD1Q96RS6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NUDCD1Q96RS6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUDCD1Q96RS6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUDCD1Q96RS6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUDCD1Q96RS6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUDCD1Q96RS6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUDCD1Q96RS6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUDCD1Q96RS6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
NUDCD1Q96RS6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NUDCD1Q96RS6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUDCD1Q96RS6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NUDCD1Q96RS6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUDCD1Q96RS6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUDCD1Q96RS6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUDCD1Q96RS6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUDCD1Q96RS6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUDCD1Q96RS6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUDCD1Q96RS6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUDCD1Q96RS6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUDCD1Q96RS6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUDCD1Q96RS6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUDCD1Q96RS6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUDCD1Q96RS6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUDCD1Q96RS6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUDCD1Q96RS6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUDCD1Q96RS6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NUDCD1Q96RS6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUDCD1Q96RS6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUDCD1Q96RS6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUDCD1Q96RS6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NUDCD1Q96RS6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUDCD1Q96RS6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUDCD1Q96RS6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUDCD1Q96RS6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUDCD1Q96RS6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NUDCD1Q96RS6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUDCD1Q96RS6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUDCD1Q96RS6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUDCD1Q96RS6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUDCD1Q96RS6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUDCD1Q96RS6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUDCD1Q96RS6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUDCD1Q96RS6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUDCD1Q96RS6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUDCD1Q96RS6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUDCD1Q96RS6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUDCD1Q96RS6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUDCD1Q96RS6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUDCD1Q96RS6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUDCD1Q96RS6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms