Protein–RNA interactions for Protein: Q96NU1

SAMD11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD11Q96NU1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SAMD11Q96NU1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SAMD11Q96NU1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SAMD11Q96NU1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SAMD11Q96NU1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SAMD11Q96NU1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SAMD11Q96NU1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SAMD11Q96NU1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SAMD11Q96NU1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SAMD11Q96NU1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SAMD11Q96NU1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SAMD11Q96NU1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SAMD11Q96NU1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SAMD11Q96NU1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SAMD11Q96NU1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SAMD11Q96NU1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SAMD11Q96NU1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SAMD11Q96NU1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SAMD11Q96NU1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SAMD11Q96NU1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SAMD11Q96NU1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SAMD11Q96NU1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SAMD11Q96NU1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SAMD11Q96NU1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SAMD11Q96NU1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SAMD11Q96NU1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SAMD11Q96NU1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SAMD11Q96NU1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SAMD11Q96NU1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SAMD11Q96NU1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SAMD11Q96NU1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SAMD11Q96NU1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SAMD11Q96NU1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SAMD11Q96NU1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SAMD11Q96NU1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SAMD11Q96NU1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SAMD11Q96NU1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SAMD11Q96NU1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SAMD11Q96NU1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SAMD11Q96NU1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SAMD11Q96NU1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SAMD11Q96NU1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SAMD11Q96NU1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SAMD11Q96NU1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SAMD11Q96NU1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SAMD11Q96NU1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SAMD11Q96NU1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SAMD11Q96NU1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SAMD11Q96NU1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SAMD11Q96NU1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SAMD11Q96NU1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SAMD11Q96NU1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SAMD11Q96NU1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SAMD11Q96NU1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SAMD11Q96NU1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SAMD11Q96NU1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SAMD11Q96NU1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SAMD11Q96NU1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SAMD11Q96NU1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SAMD11Q96NU1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SAMD11Q96NU1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SAMD11Q96NU1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SAMD11Q96NU1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SAMD11Q96NU1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SAMD11Q96NU1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SAMD11Q96NU1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SAMD11Q96NU1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SAMD11Q96NU1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SAMD11Q96NU1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SAMD11Q96NU1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SAMD11Q96NU1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SAMD11Q96NU1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SAMD11Q96NU1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SAMD11Q96NU1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SAMD11Q96NU1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SAMD11Q96NU1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SAMD11Q96NU1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SAMD11Q96NU1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SAMD11Q96NU1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SAMD11Q96NU1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SAMD11Q96NU1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SAMD11Q96NU1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.51■■■□□ 2
SAMD11Q96NU1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SAMD11Q96NU1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SAMD11Q96NU1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SAMD11Q96NU1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SAMD11Q96NU1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SAMD11Q96NU1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SAMD11Q96NU1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SAMD11Q96NU1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SAMD11Q96NU1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SAMD11Q96NU1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SAMD11Q96NU1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SAMD11Q96NU1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SAMD11Q96NU1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SAMD11Q96NU1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SAMD11Q96NU1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SAMD11Q96NU1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SAMD11Q96NU1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SAMD11Q96NU1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms