Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN8

NEURL4, Neuralized-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL4Q96JN8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
NEURL4Q96JN8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
NEURL4Q96JN8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
NEURL4Q96JN8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
NEURL4Q96JN8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
NEURL4Q96JN8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
NEURL4Q96JN8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
NEURL4Q96JN8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
NEURL4Q96JN8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
NEURL4Q96JN8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
NEURL4Q96JN8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
NEURL4Q96JN8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
NEURL4Q96JN8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
NEURL4Q96JN8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
NEURL4Q96JN8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
NEURL4Q96JN8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
NEURL4Q96JN8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
NEURL4Q96JN8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
NEURL4Q96JN8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC37.82■■■■□ 3.64
NEURL4Q96JN8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
NEURL4Q96JN8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
NEURL4Q96JN8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
NEURL4Q96JN8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
NEURL4Q96JN8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
NEURL4Q96JN8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
NEURL4Q96JN8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
NEURL4Q96JN8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
NEURL4Q96JN8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
NEURL4Q96JN8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
NEURL4Q96JN8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
NEURL4Q96JN8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
NEURL4Q96JN8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
NEURL4Q96JN8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
NEURL4Q96JN8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
NEURL4Q96JN8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
NEURL4Q96JN8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
NEURL4Q96JN8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
NEURL4Q96JN8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
NEURL4Q96JN8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
NEURL4Q96JN8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
NEURL4Q96JN8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
NEURL4Q96JN8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
NEURL4Q96JN8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
NEURL4Q96JN8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
NEURL4Q96JN8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
NEURL4Q96JN8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
NEURL4Q96JN8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
NEURL4Q96JN8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
NEURL4Q96JN8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
NEURL4Q96JN8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
NEURL4Q96JN8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
NEURL4Q96JN8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
NEURL4Q96JN8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
NEURL4Q96JN8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
NEURL4Q96JN8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC37.64■■■■□ 3.62
NEURL4Q96JN8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC37.64■■■■□ 3.62
NEURL4Q96JN8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
NEURL4Q96JN8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
NEURL4Q96JN8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
NEURL4Q96JN8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
NEURL4Q96JN8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
NEURL4Q96JN8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
NEURL4Q96JN8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
NEURL4Q96JN8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
NEURL4Q96JN8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
NEURL4Q96JN8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
NEURL4Q96JN8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
NEURL4Q96JN8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
NEURL4Q96JN8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC37.58■■■■□ 3.61
NEURL4Q96JN8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
NEURL4Q96JN8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
NEURL4Q96JN8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
NEURL4Q96JN8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
NEURL4Q96JN8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
NEURL4Q96JN8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
NEURL4Q96JN8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
NEURL4Q96JN8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
NEURL4Q96JN8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
NEURL4Q96JN8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
NEURL4Q96JN8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
NEURL4Q96JN8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
NEURL4Q96JN8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC37.51■■■■□ 3.6
NEURL4Q96JN8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC37.51■■■■□ 3.59
NEURL4Q96JN8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
NEURL4Q96JN8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
NEURL4Q96JN8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
NEURL4Q96JN8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
NEURL4Q96JN8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
NEURL4Q96JN8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
NEURL4Q96JN8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
NEURL4Q96JN8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
NEURL4Q96JN8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
NEURL4Q96JN8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
NEURL4Q96JN8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
NEURL4Q96JN8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
NEURL4Q96JN8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
NEURL4Q96JN8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
NEURL4Q96JN8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
NEURL4Q96JN8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC37.44■■■■□ 3.58
NEURL4Q96JN8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms