Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
BORCS6Q96GS4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BORCS6Q96GS4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BORCS6Q96GS4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BORCS6Q96GS4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BORCS6Q96GS4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
BORCS6Q96GS4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BORCS6Q96GS4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
BORCS6Q96GS4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
BORCS6Q96GS4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
BORCS6Q96GS4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
BORCS6Q96GS4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BORCS6Q96GS4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BORCS6Q96GS4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BORCS6Q96GS4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BORCS6Q96GS4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BORCS6Q96GS4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BORCS6Q96GS4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BORCS6Q96GS4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BORCS6Q96GS4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BORCS6Q96GS4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BORCS6Q96GS4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BORCS6Q96GS4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BORCS6Q96GS4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BORCS6Q96GS4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BORCS6Q96GS4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BORCS6Q96GS4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BORCS6Q96GS4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BORCS6Q96GS4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BORCS6Q96GS4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BORCS6Q96GS4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BORCS6Q96GS4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BORCS6Q96GS4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BORCS6Q96GS4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BORCS6Q96GS4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BORCS6Q96GS4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BORCS6Q96GS4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BORCS6Q96GS4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BORCS6Q96GS4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BORCS6Q96GS4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
BORCS6Q96GS4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BORCS6Q96GS4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BORCS6Q96GS4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BORCS6Q96GS4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BORCS6Q96GS4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
BORCS6Q96GS4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BORCS6Q96GS4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BORCS6Q96GS4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BORCS6Q96GS4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BORCS6Q96GS4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BORCS6Q96GS4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BORCS6Q96GS4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28■■■□□ 2.07
BORCS6Q96GS4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
BORCS6Q96GS4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
BORCS6Q96GS4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BORCS6Q96GS4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28■■■□□ 2.07
BORCS6Q96GS4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BORCS6Q96GS4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BORCS6Q96GS4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BORCS6Q96GS4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BORCS6Q96GS4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BORCS6Q96GS4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BORCS6Q96GS4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BORCS6Q96GS4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BORCS6Q96GS4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BORCS6Q96GS4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BORCS6Q96GS4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BORCS6Q96GS4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BORCS6Q96GS4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
BORCS6Q96GS4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BORCS6Q96GS4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BORCS6Q96GS4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BORCS6Q96GS4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BORCS6Q96GS4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BORCS6Q96GS4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BORCS6Q96GS4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BORCS6Q96GS4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BORCS6Q96GS4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
BORCS6Q96GS4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BORCS6Q96GS4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BORCS6Q96GS4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BORCS6Q96GS4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BORCS6Q96GS4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BORCS6Q96GS4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BORCS6Q96GS4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BORCS6Q96GS4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BORCS6Q96GS4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
BORCS6Q96GS4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BORCS6Q96GS4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BORCS6Q96GS4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BORCS6Q96GS4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BORCS6Q96GS4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BORCS6Q96GS4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BORCS6Q96GS4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BORCS6Q96GS4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BORCS6Q96GS4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BORCS6Q96GS4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BORCS6Q96GS4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BORCS6Q96GS4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BORCS6Q96GS4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms