Protein–RNA interactions for Protein: Q96FT7

ASIC4, Acid-sensing ion channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC4Q96FT7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ASIC4Q96FT7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ASIC4Q96FT7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ASIC4Q96FT7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ASIC4Q96FT7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ASIC4Q96FT7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ASIC4Q96FT7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ASIC4Q96FT7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ASIC4Q96FT7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ASIC4Q96FT7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ASIC4Q96FT7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ASIC4Q96FT7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ASIC4Q96FT7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ASIC4Q96FT7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ASIC4Q96FT7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ASIC4Q96FT7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ASIC4Q96FT7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ASIC4Q96FT7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ASIC4Q96FT7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ASIC4Q96FT7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ASIC4Q96FT7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ASIC4Q96FT7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ASIC4Q96FT7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ASIC4Q96FT7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ASIC4Q96FT7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ASIC4Q96FT7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ASIC4Q96FT7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ASIC4Q96FT7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ASIC4Q96FT7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ASIC4Q96FT7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ASIC4Q96FT7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ASIC4Q96FT7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ASIC4Q96FT7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ASIC4Q96FT7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ASIC4Q96FT7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ASIC4Q96FT7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ASIC4Q96FT7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ASIC4Q96FT7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ASIC4Q96FT7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ASIC4Q96FT7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ASIC4Q96FT7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ASIC4Q96FT7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ASIC4Q96FT7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ASIC4Q96FT7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ASIC4Q96FT7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ASIC4Q96FT7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ASIC4Q96FT7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ASIC4Q96FT7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ASIC4Q96FT7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ASIC4Q96FT7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ASIC4Q96FT7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ASIC4Q96FT7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ASIC4Q96FT7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ASIC4Q96FT7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ASIC4Q96FT7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ASIC4Q96FT7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ASIC4Q96FT7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ASIC4Q96FT7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ASIC4Q96FT7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ASIC4Q96FT7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ASIC4Q96FT7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ASIC4Q96FT7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ASIC4Q96FT7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ASIC4Q96FT7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ASIC4Q96FT7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ASIC4Q96FT7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ASIC4Q96FT7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ASIC4Q96FT7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ASIC4Q96FT7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ASIC4Q96FT7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ASIC4Q96FT7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ASIC4Q96FT7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ASIC4Q96FT7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ASIC4Q96FT7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ASIC4Q96FT7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ASIC4Q96FT7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ASIC4Q96FT7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ASIC4Q96FT7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ASIC4Q96FT7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ASIC4Q96FT7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ASIC4Q96FT7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ASIC4Q96FT7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ASIC4Q96FT7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ASIC4Q96FT7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ASIC4Q96FT7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ASIC4Q96FT7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ASIC4Q96FT7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ASIC4Q96FT7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ASIC4Q96FT7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ASIC4Q96FT7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ASIC4Q96FT7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ASIC4Q96FT7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ASIC4Q96FT7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ASIC4Q96FT7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ASIC4Q96FT7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ASIC4Q96FT7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ASIC4Q96FT7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ASIC4Q96FT7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ASIC4Q96FT7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ASIC4Q96FT7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms