Protein–RNA interactions for Protein: Q96BA8

CREB3L1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L1Q96BA8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CREB3L1Q96BA8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CREB3L1Q96BA8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CREB3L1Q96BA8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CREB3L1Q96BA8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CREB3L1Q96BA8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CREB3L1Q96BA8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CREB3L1Q96BA8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CREB3L1Q96BA8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CREB3L1Q96BA8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CREB3L1Q96BA8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CREB3L1Q96BA8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CREB3L1Q96BA8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CREB3L1Q96BA8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CREB3L1Q96BA8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CREB3L1Q96BA8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CREB3L1Q96BA8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CREB3L1Q96BA8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CREB3L1Q96BA8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CREB3L1Q96BA8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CREB3L1Q96BA8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CREB3L1Q96BA8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CREB3L1Q96BA8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CREB3L1Q96BA8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CREB3L1Q96BA8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CREB3L1Q96BA8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CREB3L1Q96BA8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CREB3L1Q96BA8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CREB3L1Q96BA8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CREB3L1Q96BA8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CREB3L1Q96BA8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CREB3L1Q96BA8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CREB3L1Q96BA8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CREB3L1Q96BA8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CREB3L1Q96BA8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CREB3L1Q96BA8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CREB3L1Q96BA8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CREB3L1Q96BA8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CREB3L1Q96BA8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CREB3L1Q96BA8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CREB3L1Q96BA8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CREB3L1Q96BA8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CREB3L1Q96BA8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CREB3L1Q96BA8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CREB3L1Q96BA8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CREB3L1Q96BA8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CREB3L1Q96BA8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CREB3L1Q96BA8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CREB3L1Q96BA8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CREB3L1Q96BA8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CREB3L1Q96BA8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CREB3L1Q96BA8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CREB3L1Q96BA8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CREB3L1Q96BA8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREB3L1Q96BA8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREB3L1Q96BA8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREB3L1Q96BA8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREB3L1Q96BA8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREB3L1Q96BA8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CREB3L1Q96BA8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CREB3L1Q96BA8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CREB3L1Q96BA8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CREB3L1Q96BA8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CREB3L1Q96BA8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CREB3L1Q96BA8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CREB3L1Q96BA8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CREB3L1Q96BA8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CREB3L1Q96BA8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CREB3L1Q96BA8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CREB3L1Q96BA8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CREB3L1Q96BA8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB3L1Q96BA8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB3L1Q96BA8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB3L1Q96BA8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB3L1Q96BA8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB3L1Q96BA8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CREB3L1Q96BA8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CREB3L1Q96BA8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CREB3L1Q96BA8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CREB3L1Q96BA8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CREB3L1Q96BA8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CREB3L1Q96BA8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CREB3L1Q96BA8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CREB3L1Q96BA8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CREB3L1Q96BA8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CREB3L1Q96BA8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CREB3L1Q96BA8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CREB3L1Q96BA8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CREB3L1Q96BA8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CREB3L1Q96BA8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CREB3L1Q96BA8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CREB3L1Q96BA8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CREB3L1Q96BA8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREB3L1Q96BA8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREB3L1Q96BA8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CREB3L1Q96BA8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREB3L1Q96BA8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREB3L1Q96BA8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CREB3L1Q96BA8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CREB3L1Q96BA8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.4 ms