Protein–RNA interactions for Protein: Q969M3

YIPF5, Protein YIPF5, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF5Q969M3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YIPF5Q969M3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YIPF5Q969M3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YIPF5Q969M3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YIPF5Q969M3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YIPF5Q969M3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YIPF5Q969M3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YIPF5Q969M3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
YIPF5Q969M3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
YIPF5Q969M3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
YIPF5Q969M3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
YIPF5Q969M3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
YIPF5Q969M3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
YIPF5Q969M3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YIPF5Q969M3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
YIPF5Q969M3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
YIPF5Q969M3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
YIPF5Q969M3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
YIPF5Q969M3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
YIPF5Q969M3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
YIPF5Q969M3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
YIPF5Q969M3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
YIPF5Q969M3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
YIPF5Q969M3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
YIPF5Q969M3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
YIPF5Q969M3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
YIPF5Q969M3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
YIPF5Q969M3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
YIPF5Q969M3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
YIPF5Q969M3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
YIPF5Q969M3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YIPF5Q969M3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
YIPF5Q969M3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YIPF5Q969M3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
YIPF5Q969M3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YIPF5Q969M3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YIPF5Q969M3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YIPF5Q969M3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YIPF5Q969M3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
YIPF5Q969M3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YIPF5Q969M3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YIPF5Q969M3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YIPF5Q969M3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
YIPF5Q969M3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YIPF5Q969M3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
YIPF5Q969M3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
YIPF5Q969M3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
YIPF5Q969M3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YIPF5Q969M3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
YIPF5Q969M3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YIPF5Q969M3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
YIPF5Q969M3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
YIPF5Q969M3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
YIPF5Q969M3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YIPF5Q969M3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YIPF5Q969M3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
YIPF5Q969M3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YIPF5Q969M3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
YIPF5Q969M3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YIPF5Q969M3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
YIPF5Q969M3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
YIPF5Q969M3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
YIPF5Q969M3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
YIPF5Q969M3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
YIPF5Q969M3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
YIPF5Q969M3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
YIPF5Q969M3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
YIPF5Q969M3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YIPF5Q969M3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YIPF5Q969M3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YIPF5Q969M3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YIPF5Q969M3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YIPF5Q969M3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YIPF5Q969M3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YIPF5Q969M3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YIPF5Q969M3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YIPF5Q969M3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YIPF5Q969M3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YIPF5Q969M3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YIPF5Q969M3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YIPF5Q969M3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YIPF5Q969M3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YIPF5Q969M3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YIPF5Q969M3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YIPF5Q969M3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
YIPF5Q969M3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YIPF5Q969M3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YIPF5Q969M3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YIPF5Q969M3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
YIPF5Q969M3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
YIPF5Q969M3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
YIPF5Q969M3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
YIPF5Q969M3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YIPF5Q969M3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
YIPF5Q969M3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
YIPF5Q969M3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YIPF5Q969M3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YIPF5Q969M3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YIPF5Q969M3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YIPF5Q969M3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms