Protein–RNA interactions for Protein: Q93038

TNFRSF25, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 25, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25Q93038 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TNFRSF25Q93038 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
TNFRSF25Q93038 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TNFRSF25Q93038 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TNFRSF25Q93038 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TNFRSF25Q93038 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TNFRSF25Q93038 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TNFRSF25Q93038 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
TNFRSF25Q93038 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TNFRSF25Q93038 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TNFRSF25Q93038 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TNFRSF25Q93038 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TNFRSF25Q93038 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TNFRSF25Q93038 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TNFRSF25Q93038 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TNFRSF25Q93038 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TNFRSF25Q93038 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
TNFRSF25Q93038 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TNFRSF25Q93038 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TNFRSF25Q93038 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TNFRSF25Q93038 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TNFRSF25Q93038 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TNFRSF25Q93038 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TNFRSF25Q93038 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TNFRSF25Q93038 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TNFRSF25Q93038 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TNFRSF25Q93038 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TNFRSF25Q93038 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
TNFRSF25Q93038 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TNFRSF25Q93038 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TNFRSF25Q93038 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TNFRSF25Q93038 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TNFRSF25Q93038 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TNFRSF25Q93038 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TNFRSF25Q93038 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNFRSF25Q93038 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNFRSF25Q93038 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNFRSF25Q93038 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNFRSF25Q93038 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNFRSF25Q93038 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNFRSF25Q93038 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNFRSF25Q93038 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNFRSF25Q93038 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNFRSF25Q93038 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNFRSF25Q93038 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNFRSF25Q93038 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNFRSF25Q93038 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNFRSF25Q93038 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNFRSF25Q93038 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNFRSF25Q93038 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNFRSF25Q93038 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNFRSF25Q93038 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNFRSF25Q93038 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNFRSF25Q93038 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNFRSF25Q93038 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNFRSF25Q93038 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNFRSF25Q93038 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNFRSF25Q93038 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNFRSF25Q93038 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNFRSF25Q93038 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNFRSF25Q93038 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNFRSF25Q93038 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNFRSF25Q93038 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
TNFRSF25Q93038 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNFRSF25Q93038 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNFRSF25Q93038 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
TNFRSF25Q93038 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNFRSF25Q93038 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNFRSF25Q93038 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNFRSF25Q93038 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNFRSF25Q93038 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNFRSF25Q93038 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNFRSF25Q93038 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNFRSF25Q93038 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNFRSF25Q93038 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNFRSF25Q93038 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNFRSF25Q93038 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNFRSF25Q93038 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNFRSF25Q93038 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNFRSF25Q93038 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNFRSF25Q93038 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNFRSF25Q93038 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNFRSF25Q93038 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNFRSF25Q93038 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNFRSF25Q93038 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNFRSF25Q93038 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNFRSF25Q93038 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNFRSF25Q93038 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNFRSF25Q93038 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNFRSF25Q93038 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNFRSF25Q93038 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
TNFRSF25Q93038 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNFRSF25Q93038 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNFRSF25Q93038 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNFRSF25Q93038 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNFRSF25Q93038 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TNFRSF25Q93038 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TNFRSF25Q93038 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TNFRSF25Q93038 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TNFRSF25Q93038 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms