Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP13Q92995 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP13Q92995 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP13Q92995 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP13Q92995 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP13Q92995 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP13Q92995 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP13Q92995 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP13Q92995 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP13Q92995 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP13Q92995 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP13Q92995 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP13Q92995 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP13Q92995 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
USP13Q92995 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP13Q92995 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP13Q92995 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP13Q92995 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
USP13Q92995 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP13Q92995 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP13Q92995 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP13Q92995 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
USP13Q92995 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP13Q92995 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP13Q92995 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP13Q92995 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP13Q92995 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP13Q92995 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP13Q92995 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP13Q92995 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP13Q92995 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP13Q92995 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP13Q92995 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP13Q92995 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP13Q92995 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP13Q92995 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP13Q92995 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP13Q92995 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP13Q92995 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP13Q92995 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP13Q92995 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP13Q92995 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP13Q92995 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP13Q92995 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP13Q92995 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP13Q92995 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP13Q92995 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP13Q92995 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP13Q92995 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP13Q92995 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP13Q92995 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP13Q92995 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP13Q92995 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP13Q92995 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP13Q92995 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP13Q92995 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP13Q92995 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP13Q92995 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP13Q92995 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP13Q92995 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP13Q92995 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP13Q92995 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP13Q92995 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP13Q92995 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP13Q92995 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP13Q92995 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP13Q92995 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
USP13Q92995 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP13Q92995 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
USP13Q92995 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP13Q92995 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
USP13Q92995 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP13Q92995 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP13Q92995 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP13Q92995 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP13Q92995 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
USP13Q92995 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP13Q92995 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP13Q92995 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP13Q92995 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP13Q92995 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP13Q92995 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP13Q92995 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP13Q92995 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP13Q92995 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP13Q92995 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
USP13Q92995 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP13Q92995 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP13Q92995 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP13Q92995 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
USP13Q92995 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
USP13Q92995 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
USP13Q92995 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP13Q92995 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP13Q92995 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP13Q92995 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP13Q92995 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP13Q92995 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP13Q92995 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP13Q92995 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.7 ms