Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GATA6Q92908 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GATA6Q92908 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GATA6Q92908 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GATA6Q92908 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GATA6Q92908 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GATA6Q92908 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GATA6Q92908 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GATA6Q92908 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GATA6Q92908 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GATA6Q92908 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GATA6Q92908 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GATA6Q92908 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GATA6Q92908 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GATA6Q92908 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GATA6Q92908 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GATA6Q92908 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GATA6Q92908 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GATA6Q92908 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GATA6Q92908 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GATA6Q92908 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GATA6Q92908 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GATA6Q92908 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GATA6Q92908 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GATA6Q92908 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GATA6Q92908 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GATA6Q92908 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GATA6Q92908 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GATA6Q92908 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GATA6Q92908 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GATA6Q92908 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GATA6Q92908 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GATA6Q92908 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GATA6Q92908 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GATA6Q92908 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GATA6Q92908 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GATA6Q92908 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GATA6Q92908 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GATA6Q92908 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GATA6Q92908 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
GATA6Q92908 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GATA6Q92908 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GATA6Q92908 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GATA6Q92908 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GATA6Q92908 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GATA6Q92908 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GATA6Q92908 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GATA6Q92908 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GATA6Q92908 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GATA6Q92908 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GATA6Q92908 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GATA6Q92908 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GATA6Q92908 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GATA6Q92908 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GATA6Q92908 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GATA6Q92908 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GATA6Q92908 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GATA6Q92908 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GATA6Q92908 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GATA6Q92908 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GATA6Q92908 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GATA6Q92908 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GATA6Q92908 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GATA6Q92908 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GATA6Q92908 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GATA6Q92908 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GATA6Q92908 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GATA6Q92908 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GATA6Q92908 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GATA6Q92908 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GATA6Q92908 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GATA6Q92908 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GATA6Q92908 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GATA6Q92908 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GATA6Q92908 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GATA6Q92908 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GATA6Q92908 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GATA6Q92908 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GATA6Q92908 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GATA6Q92908 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GATA6Q92908 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GATA6Q92908 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GATA6Q92908 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GATA6Q92908 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GATA6Q92908 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GATA6Q92908 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GATA6Q92908 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GATA6Q92908 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GATA6Q92908 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GATA6Q92908 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GATA6Q92908 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GATA6Q92908 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GATA6Q92908 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GATA6Q92908 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GATA6Q92908 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GATA6Q92908 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GATA6Q92908 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GATA6Q92908 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GATA6Q92908 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GATA6Q92908 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms