Protein–RNA interactions for Protein: Q92791

P3H4, Endoplasmic reticulum protein SC65, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H4Q92791 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
P3H4Q92791 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
P3H4Q92791 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
P3H4Q92791 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
P3H4Q92791 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
P3H4Q92791 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
P3H4Q92791 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
P3H4Q92791 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
P3H4Q92791 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
P3H4Q92791 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
P3H4Q92791 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
P3H4Q92791 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
P3H4Q92791 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
P3H4Q92791 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
P3H4Q92791 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
P3H4Q92791 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
P3H4Q92791 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
P3H4Q92791 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
P3H4Q92791 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
P3H4Q92791 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
P3H4Q92791 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
P3H4Q92791 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
P3H4Q92791 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
P3H4Q92791 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
P3H4Q92791 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
P3H4Q92791 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
P3H4Q92791 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
P3H4Q92791 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
P3H4Q92791 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
P3H4Q92791 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
P3H4Q92791 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
P3H4Q92791 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
P3H4Q92791 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
P3H4Q92791 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
P3H4Q92791 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
P3H4Q92791 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
P3H4Q92791 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
P3H4Q92791 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
P3H4Q92791 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
P3H4Q92791 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
P3H4Q92791 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
P3H4Q92791 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
P3H4Q92791 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
P3H4Q92791 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
P3H4Q92791 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
P3H4Q92791 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
P3H4Q92791 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
P3H4Q92791 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
P3H4Q92791 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
P3H4Q92791 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
P3H4Q92791 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
P3H4Q92791 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
P3H4Q92791 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
P3H4Q92791 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
P3H4Q92791 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
P3H4Q92791 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
P3H4Q92791 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
P3H4Q92791 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
P3H4Q92791 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
P3H4Q92791 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
P3H4Q92791 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
P3H4Q92791 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
P3H4Q92791 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
P3H4Q92791 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
P3H4Q92791 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
P3H4Q92791 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
P3H4Q92791 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
P3H4Q92791 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
P3H4Q92791 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
P3H4Q92791 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
P3H4Q92791 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
P3H4Q92791 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
P3H4Q92791 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
P3H4Q92791 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
P3H4Q92791 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
P3H4Q92791 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
P3H4Q92791 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
P3H4Q92791 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
P3H4Q92791 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
P3H4Q92791 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
P3H4Q92791 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
P3H4Q92791 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
P3H4Q92791 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
P3H4Q92791 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
P3H4Q92791 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
P3H4Q92791 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
P3H4Q92791 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
P3H4Q92791 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
P3H4Q92791 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
P3H4Q92791 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
P3H4Q92791 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
P3H4Q92791 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
P3H4Q92791 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
P3H4Q92791 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
P3H4Q92791 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
P3H4Q92791 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
P3H4Q92791 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
P3H4Q92791 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
P3H4Q92791 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
P3H4Q92791 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms