Protein–RNA interactions for Protein: Q92543

SNX19, Sorting nexin-19, humanhuman

Predictions only

Length 992 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX19Q92543 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNX19Q92543 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX19Q92543 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX19Q92543 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX19Q92543 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX19Q92543 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX19Q92543 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX19Q92543 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX19Q92543 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX19Q92543 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX19Q92543 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX19Q92543 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNX19Q92543 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX19Q92543 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX19Q92543 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX19Q92543 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX19Q92543 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX19Q92543 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX19Q92543 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX19Q92543 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNX19Q92543 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNX19Q92543 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNX19Q92543 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX19Q92543 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX19Q92543 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX19Q92543 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX19Q92543 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX19Q92543 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX19Q92543 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX19Q92543 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX19Q92543 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX19Q92543 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX19Q92543 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX19Q92543 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX19Q92543 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX19Q92543 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX19Q92543 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX19Q92543 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX19Q92543 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX19Q92543 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX19Q92543 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX19Q92543 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX19Q92543 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX19Q92543 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX19Q92543 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX19Q92543 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX19Q92543 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX19Q92543 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX19Q92543 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX19Q92543 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX19Q92543 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX19Q92543 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX19Q92543 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX19Q92543 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX19Q92543 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX19Q92543 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX19Q92543 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX19Q92543 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX19Q92543 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX19Q92543 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX19Q92543 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX19Q92543 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX19Q92543 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX19Q92543 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX19Q92543 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX19Q92543 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX19Q92543 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX19Q92543 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX19Q92543 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX19Q92543 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX19Q92543 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX19Q92543 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX19Q92543 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX19Q92543 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX19Q92543 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX19Q92543 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX19Q92543 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX19Q92543 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX19Q92543 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX19Q92543 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX19Q92543 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX19Q92543 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX19Q92543 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX19Q92543 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX19Q92543 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX19Q92543 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX19Q92543 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX19Q92543 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX19Q92543 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX19Q92543 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX19Q92543 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX19Q92543 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX19Q92543 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX19Q92543 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX19Q92543 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX19Q92543 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX19Q92543 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX19Q92543 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX19Q92543 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX19Q92543 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms