Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUY9

DEPDC1B, DEP domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC1BQ8WUY9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DEPDC1BQ8WUY9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DEPDC1BQ8WUY9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DEPDC1BQ8WUY9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DEPDC1BQ8WUY9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DEPDC1BQ8WUY9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DEPDC1BQ8WUY9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DEPDC1BQ8WUY9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DEPDC1BQ8WUY9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DEPDC1BQ8WUY9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DEPDC1BQ8WUY9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DEPDC1BQ8WUY9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DEPDC1BQ8WUY9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DEPDC1BQ8WUY9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DEPDC1BQ8WUY9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DEPDC1BQ8WUY9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DEPDC1BQ8WUY9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DEPDC1BQ8WUY9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DEPDC1BQ8WUY9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DEPDC1BQ8WUY9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DEPDC1BQ8WUY9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DEPDC1BQ8WUY9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DEPDC1BQ8WUY9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DEPDC1BQ8WUY9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DEPDC1BQ8WUY9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DEPDC1BQ8WUY9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DEPDC1BQ8WUY9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DEPDC1BQ8WUY9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DEPDC1BQ8WUY9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DEPDC1BQ8WUY9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DEPDC1BQ8WUY9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DEPDC1BQ8WUY9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DEPDC1BQ8WUY9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DEPDC1BQ8WUY9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
DEPDC1BQ8WUY9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DEPDC1BQ8WUY9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DEPDC1BQ8WUY9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DEPDC1BQ8WUY9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DEPDC1BQ8WUY9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DEPDC1BQ8WUY9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DEPDC1BQ8WUY9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DEPDC1BQ8WUY9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DEPDC1BQ8WUY9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DEPDC1BQ8WUY9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DEPDC1BQ8WUY9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DEPDC1BQ8WUY9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DEPDC1BQ8WUY9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DEPDC1BQ8WUY9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DEPDC1BQ8WUY9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DEPDC1BQ8WUY9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DEPDC1BQ8WUY9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DEPDC1BQ8WUY9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
DEPDC1BQ8WUY9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
DEPDC1BQ8WUY9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DEPDC1BQ8WUY9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DEPDC1BQ8WUY9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DEPDC1BQ8WUY9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DEPDC1BQ8WUY9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DEPDC1BQ8WUY9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DEPDC1BQ8WUY9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
DEPDC1BQ8WUY9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DEPDC1BQ8WUY9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
DEPDC1BQ8WUY9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DEPDC1BQ8WUY9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DEPDC1BQ8WUY9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DEPDC1BQ8WUY9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DEPDC1BQ8WUY9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DEPDC1BQ8WUY9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DEPDC1BQ8WUY9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DEPDC1BQ8WUY9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DEPDC1BQ8WUY9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DEPDC1BQ8WUY9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
DEPDC1BQ8WUY9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DEPDC1BQ8WUY9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DEPDC1BQ8WUY9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DEPDC1BQ8WUY9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DEPDC1BQ8WUY9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DEPDC1BQ8WUY9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DEPDC1BQ8WUY9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DEPDC1BQ8WUY9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
DEPDC1BQ8WUY9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DEPDC1BQ8WUY9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DEPDC1BQ8WUY9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DEPDC1BQ8WUY9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DEPDC1BQ8WUY9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DEPDC1BQ8WUY9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DEPDC1BQ8WUY9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DEPDC1BQ8WUY9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DEPDC1BQ8WUY9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DEPDC1BQ8WUY9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
DEPDC1BQ8WUY9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
DEPDC1BQ8WUY9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DEPDC1BQ8WUY9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DEPDC1BQ8WUY9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DEPDC1BQ8WUY9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DEPDC1BQ8WUY9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DEPDC1BQ8WUY9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DEPDC1BQ8WUY9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DEPDC1BQ8WUY9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DEPDC1BQ8WUY9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms