Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFD2

ANKK1, Ankyrin repeat and protein kinase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKK1Q8NFD2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ANKK1Q8NFD2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ANKK1Q8NFD2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ANKK1Q8NFD2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANKK1Q8NFD2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ANKK1Q8NFD2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ANKK1Q8NFD2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ANKK1Q8NFD2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ANKK1Q8NFD2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ANKK1Q8NFD2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ANKK1Q8NFD2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ANKK1Q8NFD2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ANKK1Q8NFD2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ANKK1Q8NFD2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ANKK1Q8NFD2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ANKK1Q8NFD2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ANKK1Q8NFD2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKK1Q8NFD2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKK1Q8NFD2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKK1Q8NFD2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKK1Q8NFD2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKK1Q8NFD2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKK1Q8NFD2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKK1Q8NFD2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ANKK1Q8NFD2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ANKK1Q8NFD2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ANKK1Q8NFD2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ANKK1Q8NFD2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ANKK1Q8NFD2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ANKK1Q8NFD2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ANKK1Q8NFD2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ANKK1Q8NFD2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ANKK1Q8NFD2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ANKK1Q8NFD2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ANKK1Q8NFD2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ANKK1Q8NFD2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ANKK1Q8NFD2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ANKK1Q8NFD2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ANKK1Q8NFD2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ANKK1Q8NFD2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ANKK1Q8NFD2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ANKK1Q8NFD2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ANKK1Q8NFD2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ANKK1Q8NFD2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ANKK1Q8NFD2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ANKK1Q8NFD2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ANKK1Q8NFD2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANKK1Q8NFD2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANKK1Q8NFD2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANKK1Q8NFD2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ANKK1Q8NFD2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ANKK1Q8NFD2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ANKK1Q8NFD2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ANKK1Q8NFD2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ANKK1Q8NFD2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKK1Q8NFD2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKK1Q8NFD2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKK1Q8NFD2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKK1Q8NFD2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKK1Q8NFD2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKK1Q8NFD2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKK1Q8NFD2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ANKK1Q8NFD2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ANKK1Q8NFD2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ANKK1Q8NFD2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ANKK1Q8NFD2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ANKK1Q8NFD2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKK1Q8NFD2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKK1Q8NFD2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKK1Q8NFD2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKK1Q8NFD2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKK1Q8NFD2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKK1Q8NFD2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKK1Q8NFD2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKK1Q8NFD2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ANKK1Q8NFD2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ANKK1Q8NFD2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ANKK1Q8NFD2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ANKK1Q8NFD2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ANKK1Q8NFD2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ANKK1Q8NFD2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ANKK1Q8NFD2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ANKK1Q8NFD2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ANKK1Q8NFD2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ANKK1Q8NFD2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ANKK1Q8NFD2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ANKK1Q8NFD2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ANKK1Q8NFD2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ANKK1Q8NFD2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ANKK1Q8NFD2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ANKK1Q8NFD2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ANKK1Q8NFD2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ANKK1Q8NFD2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ANKK1Q8NFD2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ANKK1Q8NFD2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ANKK1Q8NFD2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ANKK1Q8NFD2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ANKK1Q8NFD2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKK1Q8NFD2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKK1Q8NFD2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms