Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHLHE23Q8NDY6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHLHE23Q8NDY6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHLHE23Q8NDY6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BHLHE23Q8NDY6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BHLHE23Q8NDY6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BHLHE23Q8NDY6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BHLHE23Q8NDY6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BHLHE23Q8NDY6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BHLHE23Q8NDY6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHLHE23Q8NDY6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHLHE23Q8NDY6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHLHE23Q8NDY6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHLHE23Q8NDY6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHLHE23Q8NDY6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BHLHE23Q8NDY6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BHLHE23Q8NDY6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BHLHE23Q8NDY6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BHLHE23Q8NDY6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BHLHE23Q8NDY6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BHLHE23Q8NDY6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BHLHE23Q8NDY6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BHLHE23Q8NDY6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BHLHE23Q8NDY6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BHLHE23Q8NDY6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BHLHE23Q8NDY6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BHLHE23Q8NDY6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHLHE23Q8NDY6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHLHE23Q8NDY6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHLHE23Q8NDY6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHLHE23Q8NDY6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHLHE23Q8NDY6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHLHE23Q8NDY6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHLHE23Q8NDY6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHLHE23Q8NDY6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BHLHE23Q8NDY6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BHLHE23Q8NDY6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BHLHE23Q8NDY6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BHLHE23Q8NDY6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BHLHE23Q8NDY6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BHLHE23Q8NDY6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BHLHE23Q8NDY6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BHLHE23Q8NDY6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BHLHE23Q8NDY6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BHLHE23Q8NDY6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BHLHE23Q8NDY6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHLHE23Q8NDY6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHLHE23Q8NDY6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHLHE23Q8NDY6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHLHE23Q8NDY6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHLHE23Q8NDY6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BHLHE23Q8NDY6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHLHE23Q8NDY6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHLHE23Q8NDY6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHLHE23Q8NDY6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHLHE23Q8NDY6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHLHE23Q8NDY6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHLHE23Q8NDY6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHLHE23Q8NDY6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHLHE23Q8NDY6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BHLHE23Q8NDY6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BHLHE23Q8NDY6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BHLHE23Q8NDY6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BHLHE23Q8NDY6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BHLHE23Q8NDY6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BHLHE23Q8NDY6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BHLHE23Q8NDY6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BHLHE23Q8NDY6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BHLHE23Q8NDY6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BHLHE23Q8NDY6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BHLHE23Q8NDY6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BHLHE23Q8NDY6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BHLHE23Q8NDY6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BHLHE23Q8NDY6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BHLHE23Q8NDY6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BHLHE23Q8NDY6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BHLHE23Q8NDY6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BHLHE23Q8NDY6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BHLHE23Q8NDY6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BHLHE23Q8NDY6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BHLHE23Q8NDY6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
BHLHE23Q8NDY6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BHLHE23Q8NDY6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BHLHE23Q8NDY6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BHLHE23Q8NDY6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BHLHE23Q8NDY6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BHLHE23Q8NDY6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BHLHE23Q8NDY6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BHLHE23Q8NDY6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BHLHE23Q8NDY6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BHLHE23Q8NDY6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BHLHE23Q8NDY6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BHLHE23Q8NDY6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BHLHE23Q8NDY6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BHLHE23Q8NDY6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BHLHE23Q8NDY6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BHLHE23Q8NDY6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BHLHE23Q8NDY6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BHLHE23Q8NDY6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BHLHE23Q8NDY6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms