Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF248Q8NDW4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF248Q8NDW4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF248Q8NDW4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF248Q8NDW4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF248Q8NDW4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF248Q8NDW4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF248Q8NDW4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF248Q8NDW4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF248Q8NDW4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF248Q8NDW4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF248Q8NDW4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF248Q8NDW4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF248Q8NDW4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF248Q8NDW4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF248Q8NDW4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF248Q8NDW4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF248Q8NDW4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF248Q8NDW4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF248Q8NDW4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF248Q8NDW4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF248Q8NDW4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF248Q8NDW4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF248Q8NDW4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF248Q8NDW4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF248Q8NDW4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF248Q8NDW4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF248Q8NDW4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF248Q8NDW4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF248Q8NDW4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF248Q8NDW4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF248Q8NDW4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF248Q8NDW4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF248Q8NDW4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF248Q8NDW4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF248Q8NDW4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF248Q8NDW4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF248Q8NDW4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF248Q8NDW4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF248Q8NDW4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF248Q8NDW4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF248Q8NDW4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF248Q8NDW4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF248Q8NDW4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF248Q8NDW4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF248Q8NDW4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF248Q8NDW4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF248Q8NDW4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF248Q8NDW4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF248Q8NDW4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF248Q8NDW4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF248Q8NDW4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF248Q8NDW4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF248Q8NDW4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF248Q8NDW4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF248Q8NDW4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF248Q8NDW4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF248Q8NDW4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF248Q8NDW4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF248Q8NDW4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF248Q8NDW4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF248Q8NDW4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF248Q8NDW4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF248Q8NDW4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF248Q8NDW4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF248Q8NDW4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF248Q8NDW4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF248Q8NDW4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF248Q8NDW4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF248Q8NDW4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF248Q8NDW4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF248Q8NDW4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF248Q8NDW4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF248Q8NDW4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF248Q8NDW4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF248Q8NDW4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF248Q8NDW4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF248Q8NDW4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF248Q8NDW4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF248Q8NDW4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF248Q8NDW4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF248Q8NDW4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF248Q8NDW4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF248Q8NDW4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF248Q8NDW4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF248Q8NDW4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF248Q8NDW4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF248Q8NDW4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF248Q8NDW4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF248Q8NDW4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZNF248Q8NDW4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF248Q8NDW4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF248Q8NDW4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF248Q8NDW4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF248Q8NDW4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF248Q8NDW4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF248Q8NDW4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF248Q8NDW4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF248Q8NDW4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF248Q8NDW4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms