Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM35BQ8NCS4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM35BQ8NCS4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TMEM35BQ8NCS4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMEM35BQ8NCS4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMEM35BQ8NCS4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMEM35BQ8NCS4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMEM35BQ8NCS4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM35BQ8NCS4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM35BQ8NCS4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM35BQ8NCS4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM35BQ8NCS4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM35BQ8NCS4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM35BQ8NCS4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM35BQ8NCS4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM35BQ8NCS4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM35BQ8NCS4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM35BQ8NCS4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM35BQ8NCS4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM35BQ8NCS4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM35BQ8NCS4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM35BQ8NCS4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM35BQ8NCS4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM35BQ8NCS4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM35BQ8NCS4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM35BQ8NCS4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM35BQ8NCS4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM35BQ8NCS4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM35BQ8NCS4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM35BQ8NCS4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM35BQ8NCS4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM35BQ8NCS4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMEM35BQ8NCS4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TMEM35BQ8NCS4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TMEM35BQ8NCS4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM35BQ8NCS4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM35BQ8NCS4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM35BQ8NCS4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM35BQ8NCS4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM35BQ8NCS4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM35BQ8NCS4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM35BQ8NCS4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM35BQ8NCS4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM35BQ8NCS4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM35BQ8NCS4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM35BQ8NCS4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM35BQ8NCS4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM35BQ8NCS4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM35BQ8NCS4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM35BQ8NCS4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM35BQ8NCS4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM35BQ8NCS4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM35BQ8NCS4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM35BQ8NCS4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM35BQ8NCS4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM35BQ8NCS4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM35BQ8NCS4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM35BQ8NCS4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM35BQ8NCS4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM35BQ8NCS4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM35BQ8NCS4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
TMEM35BQ8NCS4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM35BQ8NCS4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM35BQ8NCS4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM35BQ8NCS4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM35BQ8NCS4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM35BQ8NCS4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM35BQ8NCS4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM35BQ8NCS4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM35BQ8NCS4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM35BQ8NCS4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM35BQ8NCS4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM35BQ8NCS4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM35BQ8NCS4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM35BQ8NCS4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM35BQ8NCS4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM35BQ8NCS4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM35BQ8NCS4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM35BQ8NCS4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM35BQ8NCS4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM35BQ8NCS4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM35BQ8NCS4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
TMEM35BQ8NCS4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM35BQ8NCS4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM35BQ8NCS4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM35BQ8NCS4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM35BQ8NCS4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMEM35BQ8NCS4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TMEM35BQ8NCS4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM35BQ8NCS4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM35BQ8NCS4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM35BQ8NCS4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM35BQ8NCS4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM35BQ8NCS4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM35BQ8NCS4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM35BQ8NCS4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM35BQ8NCS4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM35BQ8NCS4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM35BQ8NCS4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM35BQ8NCS4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms