Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN4

RNF169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF169Q8NCN4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNF169Q8NCN4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNF169Q8NCN4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNF169Q8NCN4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF169Q8NCN4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF169Q8NCN4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF169Q8NCN4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF169Q8NCN4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF169Q8NCN4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNF169Q8NCN4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNF169Q8NCN4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF169Q8NCN4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF169Q8NCN4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF169Q8NCN4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF169Q8NCN4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF169Q8NCN4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNF169Q8NCN4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RNF169Q8NCN4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RNF169Q8NCN4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RNF169Q8NCN4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RNF169Q8NCN4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF169Q8NCN4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF169Q8NCN4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF169Q8NCN4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF169Q8NCN4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF169Q8NCN4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF169Q8NCN4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF169Q8NCN4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF169Q8NCN4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RNF169Q8NCN4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RNF169Q8NCN4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RNF169Q8NCN4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF169Q8NCN4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF169Q8NCN4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF169Q8NCN4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF169Q8NCN4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RNF169Q8NCN4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RNF169Q8NCN4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RNF169Q8NCN4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RNF169Q8NCN4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RNF169Q8NCN4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RNF169Q8NCN4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RNF169Q8NCN4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RNF169Q8NCN4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RNF169Q8NCN4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RNF169Q8NCN4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF169Q8NCN4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF169Q8NCN4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF169Q8NCN4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF169Q8NCN4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF169Q8NCN4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF169Q8NCN4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF169Q8NCN4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF169Q8NCN4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF169Q8NCN4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF169Q8NCN4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF169Q8NCN4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF169Q8NCN4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RNF169Q8NCN4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RNF169Q8NCN4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RNF169Q8NCN4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RNF169Q8NCN4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF169Q8NCN4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF169Q8NCN4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF169Q8NCN4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF169Q8NCN4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF169Q8NCN4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF169Q8NCN4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF169Q8NCN4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF169Q8NCN4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF169Q8NCN4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF169Q8NCN4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF169Q8NCN4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF169Q8NCN4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF169Q8NCN4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF169Q8NCN4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF169Q8NCN4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF169Q8NCN4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF169Q8NCN4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF169Q8NCN4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF169Q8NCN4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF169Q8NCN4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF169Q8NCN4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF169Q8NCN4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
RNF169Q8NCN4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF169Q8NCN4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF169Q8NCN4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF169Q8NCN4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF169Q8NCN4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF169Q8NCN4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF169Q8NCN4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF169Q8NCN4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF169Q8NCN4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF169Q8NCN4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF169Q8NCN4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF169Q8NCN4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RNF169Q8NCN4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RNF169Q8NCN4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RNF169Q8NCN4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RNF169Q8NCN4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms