Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC06

ACBD4, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD4Q8NC06 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ACBD4Q8NC06 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACBD4Q8NC06 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACBD4Q8NC06 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACBD4Q8NC06 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACBD4Q8NC06 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACBD4Q8NC06 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACBD4Q8NC06 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACBD4Q8NC06 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACBD4Q8NC06 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACBD4Q8NC06 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACBD4Q8NC06 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACBD4Q8NC06 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACBD4Q8NC06 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACBD4Q8NC06 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACBD4Q8NC06 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACBD4Q8NC06 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACBD4Q8NC06 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACBD4Q8NC06 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACBD4Q8NC06 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACBD4Q8NC06 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACBD4Q8NC06 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACBD4Q8NC06 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACBD4Q8NC06 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACBD4Q8NC06 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACBD4Q8NC06 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACBD4Q8NC06 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACBD4Q8NC06 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ACBD4Q8NC06 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACBD4Q8NC06 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACBD4Q8NC06 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACBD4Q8NC06 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACBD4Q8NC06 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACBD4Q8NC06 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACBD4Q8NC06 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ACBD4Q8NC06 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ACBD4Q8NC06 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACBD4Q8NC06 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ACBD4Q8NC06 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACBD4Q8NC06 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACBD4Q8NC06 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACBD4Q8NC06 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACBD4Q8NC06 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ACBD4Q8NC06 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACBD4Q8NC06 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACBD4Q8NC06 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACBD4Q8NC06 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACBD4Q8NC06 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACBD4Q8NC06 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACBD4Q8NC06 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACBD4Q8NC06 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACBD4Q8NC06 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACBD4Q8NC06 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACBD4Q8NC06 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ACBD4Q8NC06 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACBD4Q8NC06 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACBD4Q8NC06 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACBD4Q8NC06 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACBD4Q8NC06 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACBD4Q8NC06 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACBD4Q8NC06 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACBD4Q8NC06 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACBD4Q8NC06 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACBD4Q8NC06 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACBD4Q8NC06 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ACBD4Q8NC06 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACBD4Q8NC06 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACBD4Q8NC06 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACBD4Q8NC06 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACBD4Q8NC06 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACBD4Q8NC06 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACBD4Q8NC06 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACBD4Q8NC06 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACBD4Q8NC06 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACBD4Q8NC06 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACBD4Q8NC06 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACBD4Q8NC06 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACBD4Q8NC06 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACBD4Q8NC06 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACBD4Q8NC06 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACBD4Q8NC06 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACBD4Q8NC06 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACBD4Q8NC06 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACBD4Q8NC06 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACBD4Q8NC06 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACBD4Q8NC06 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACBD4Q8NC06 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACBD4Q8NC06 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACBD4Q8NC06 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACBD4Q8NC06 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACBD4Q8NC06 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACBD4Q8NC06 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACBD4Q8NC06 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACBD4Q8NC06 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ACBD4Q8NC06 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACBD4Q8NC06 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACBD4Q8NC06 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACBD4Q8NC06 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACBD4Q8NC06 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACBD4Q8NC06 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms