Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBK3

SUMF1, Sulfatase-modifying factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMF1Q8NBK3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SUMF1Q8NBK3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SUMF1Q8NBK3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SUMF1Q8NBK3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SUMF1Q8NBK3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SUMF1Q8NBK3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SUMF1Q8NBK3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SUMF1Q8NBK3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SUMF1Q8NBK3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SUMF1Q8NBK3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SUMF1Q8NBK3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SUMF1Q8NBK3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SUMF1Q8NBK3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SUMF1Q8NBK3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SUMF1Q8NBK3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SUMF1Q8NBK3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SUMF1Q8NBK3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SUMF1Q8NBK3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SUMF1Q8NBK3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SUMF1Q8NBK3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SUMF1Q8NBK3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SUMF1Q8NBK3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SUMF1Q8NBK3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SUMF1Q8NBK3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SUMF1Q8NBK3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SUMF1Q8NBK3 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SUMF1Q8NBK3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SUMF1Q8NBK3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SUMF1Q8NBK3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SUMF1Q8NBK3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SUMF1Q8NBK3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SUMF1Q8NBK3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SUMF1Q8NBK3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SUMF1Q8NBK3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SUMF1Q8NBK3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SUMF1Q8NBK3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SUMF1Q8NBK3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SUMF1Q8NBK3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SUMF1Q8NBK3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SUMF1Q8NBK3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SUMF1Q8NBK3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SUMF1Q8NBK3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SUMF1Q8NBK3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SUMF1Q8NBK3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SUMF1Q8NBK3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SUMF1Q8NBK3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SUMF1Q8NBK3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SUMF1Q8NBK3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SUMF1Q8NBK3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SUMF1Q8NBK3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SUMF1Q8NBK3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SUMF1Q8NBK3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SUMF1Q8NBK3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SUMF1Q8NBK3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SUMF1Q8NBK3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SUMF1Q8NBK3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SUMF1Q8NBK3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SUMF1Q8NBK3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SUMF1Q8NBK3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SUMF1Q8NBK3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SUMF1Q8NBK3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SUMF1Q8NBK3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SUMF1Q8NBK3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SUMF1Q8NBK3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SUMF1Q8NBK3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SUMF1Q8NBK3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SUMF1Q8NBK3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SUMF1Q8NBK3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SUMF1Q8NBK3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SUMF1Q8NBK3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SUMF1Q8NBK3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SUMF1Q8NBK3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SUMF1Q8NBK3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SUMF1Q8NBK3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SUMF1Q8NBK3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SUMF1Q8NBK3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SUMF1Q8NBK3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SUMF1Q8NBK3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SUMF1Q8NBK3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SUMF1Q8NBK3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SUMF1Q8NBK3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SUMF1Q8NBK3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SUMF1Q8NBK3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SUMF1Q8NBK3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SUMF1Q8NBK3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SUMF1Q8NBK3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SUMF1Q8NBK3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SUMF1Q8NBK3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SUMF1Q8NBK3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SUMF1Q8NBK3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SUMF1Q8NBK3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SUMF1Q8NBK3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SUMF1Q8NBK3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SUMF1Q8NBK3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SUMF1Q8NBK3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SUMF1Q8NBK3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SUMF1Q8NBK3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SUMF1Q8NBK3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SUMF1Q8NBK3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SUMF1Q8NBK3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms