Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9Z9

LMNTD1, Lamin tail domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD1Q8N9Z9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMNTD1Q8N9Z9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMNTD1Q8N9Z9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMNTD1Q8N9Z9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMNTD1Q8N9Z9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMNTD1Q8N9Z9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMNTD1Q8N9Z9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMNTD1Q8N9Z9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMNTD1Q8N9Z9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMNTD1Q8N9Z9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMNTD1Q8N9Z9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LMNTD1Q8N9Z9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LMNTD1Q8N9Z9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMNTD1Q8N9Z9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMNTD1Q8N9Z9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LMNTD1Q8N9Z9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMNTD1Q8N9Z9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMNTD1Q8N9Z9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMNTD1Q8N9Z9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMNTD1Q8N9Z9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMNTD1Q8N9Z9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMNTD1Q8N9Z9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMNTD1Q8N9Z9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMNTD1Q8N9Z9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMNTD1Q8N9Z9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMNTD1Q8N9Z9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMNTD1Q8N9Z9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMNTD1Q8N9Z9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMNTD1Q8N9Z9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMNTD1Q8N9Z9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMNTD1Q8N9Z9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMNTD1Q8N9Z9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMNTD1Q8N9Z9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMNTD1Q8N9Z9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMNTD1Q8N9Z9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMNTD1Q8N9Z9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMNTD1Q8N9Z9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMNTD1Q8N9Z9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMNTD1Q8N9Z9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMNTD1Q8N9Z9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LMNTD1Q8N9Z9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LMNTD1Q8N9Z9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LMNTD1Q8N9Z9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMNTD1Q8N9Z9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMNTD1Q8N9Z9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMNTD1Q8N9Z9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LMNTD1Q8N9Z9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMNTD1Q8N9Z9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMNTD1Q8N9Z9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMNTD1Q8N9Z9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LMNTD1Q8N9Z9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LMNTD1Q8N9Z9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LMNTD1Q8N9Z9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMNTD1Q8N9Z9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LMNTD1Q8N9Z9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMNTD1Q8N9Z9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMNTD1Q8N9Z9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMNTD1Q8N9Z9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMNTD1Q8N9Z9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMNTD1Q8N9Z9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMNTD1Q8N9Z9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMNTD1Q8N9Z9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LMNTD1Q8N9Z9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMNTD1Q8N9Z9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMNTD1Q8N9Z9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMNTD1Q8N9Z9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMNTD1Q8N9Z9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMNTD1Q8N9Z9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMNTD1Q8N9Z9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMNTD1Q8N9Z9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMNTD1Q8N9Z9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMNTD1Q8N9Z9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMNTD1Q8N9Z9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMNTD1Q8N9Z9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMNTD1Q8N9Z9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMNTD1Q8N9Z9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMNTD1Q8N9Z9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMNTD1Q8N9Z9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMNTD1Q8N9Z9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMNTD1Q8N9Z9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMNTD1Q8N9Z9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMNTD1Q8N9Z9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMNTD1Q8N9Z9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMNTD1Q8N9Z9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMNTD1Q8N9Z9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMNTD1Q8N9Z9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMNTD1Q8N9Z9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LMNTD1Q8N9Z9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMNTD1Q8N9Z9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMNTD1Q8N9Z9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMNTD1Q8N9Z9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMNTD1Q8N9Z9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMNTD1Q8N9Z9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMNTD1Q8N9Z9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LMNTD1Q8N9Z9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMNTD1Q8N9Z9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMNTD1Q8N9Z9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMNTD1Q8N9Z9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMNTD1Q8N9Z9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMNTD1Q8N9Z9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.7 ms