Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RTL3Q8N8U3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
RTL3Q8N8U3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RTL3Q8N8U3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RTL3Q8N8U3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RTL3Q8N8U3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RTL3Q8N8U3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RTL3Q8N8U3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RTL3Q8N8U3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RTL3Q8N8U3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RTL3Q8N8U3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RTL3Q8N8U3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RTL3Q8N8U3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RTL3Q8N8U3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RTL3Q8N8U3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RTL3Q8N8U3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RTL3Q8N8U3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RTL3Q8N8U3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RTL3Q8N8U3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RTL3Q8N8U3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RTL3Q8N8U3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RTL3Q8N8U3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RTL3Q8N8U3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RTL3Q8N8U3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RTL3Q8N8U3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RTL3Q8N8U3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RTL3Q8N8U3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RTL3Q8N8U3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RTL3Q8N8U3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RTL3Q8N8U3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
RTL3Q8N8U3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RTL3Q8N8U3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RTL3Q8N8U3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RTL3Q8N8U3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RTL3Q8N8U3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RTL3Q8N8U3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RTL3Q8N8U3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RTL3Q8N8U3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RTL3Q8N8U3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RTL3Q8N8U3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RTL3Q8N8U3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RTL3Q8N8U3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RTL3Q8N8U3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RTL3Q8N8U3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RTL3Q8N8U3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RTL3Q8N8U3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RTL3Q8N8U3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RTL3Q8N8U3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RTL3Q8N8U3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RTL3Q8N8U3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RTL3Q8N8U3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RTL3Q8N8U3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RTL3Q8N8U3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RTL3Q8N8U3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RTL3Q8N8U3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RTL3Q8N8U3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RTL3Q8N8U3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RTL3Q8N8U3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
RTL3Q8N8U3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
RTL3Q8N8U3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
RTL3Q8N8U3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RTL3Q8N8U3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RTL3Q8N8U3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RTL3Q8N8U3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RTL3Q8N8U3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RTL3Q8N8U3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RTL3Q8N8U3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RTL3Q8N8U3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RTL3Q8N8U3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RTL3Q8N8U3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RTL3Q8N8U3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RTL3Q8N8U3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RTL3Q8N8U3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RTL3Q8N8U3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RTL3Q8N8U3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RTL3Q8N8U3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RTL3Q8N8U3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RTL3Q8N8U3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RTL3Q8N8U3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RTL3Q8N8U3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RTL3Q8N8U3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RTL3Q8N8U3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RTL3Q8N8U3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RTL3Q8N8U3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RTL3Q8N8U3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RTL3Q8N8U3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RTL3Q8N8U3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RTL3Q8N8U3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RTL3Q8N8U3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RTL3Q8N8U3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RTL3Q8N8U3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RTL3Q8N8U3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RTL3Q8N8U3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RTL3Q8N8U3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RTL3Q8N8U3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RTL3Q8N8U3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RTL3Q8N8U3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RTL3Q8N8U3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RTL3Q8N8U3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RTL3Q8N8U3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms