Protein–RNA interactions for Protein: Q8N806

UBR7, Putative E3 ubiquitin-protein ligase UBR7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR7Q8N806 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBR7Q8N806 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBR7Q8N806 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
UBR7Q8N806 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
UBR7Q8N806 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
UBR7Q8N806 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
UBR7Q8N806 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
UBR7Q8N806 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
UBR7Q8N806 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBR7Q8N806 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBR7Q8N806 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBR7Q8N806 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBR7Q8N806 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBR7Q8N806 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBR7Q8N806 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBR7Q8N806 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBR7Q8N806 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBR7Q8N806 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
UBR7Q8N806 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
UBR7Q8N806 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
UBR7Q8N806 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
UBR7Q8N806 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
UBR7Q8N806 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBR7Q8N806 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
UBR7Q8N806 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
UBR7Q8N806 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBR7Q8N806 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBR7Q8N806 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBR7Q8N806 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBR7Q8N806 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBR7Q8N806 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBR7Q8N806 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBR7Q8N806 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBR7Q8N806 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBR7Q8N806 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBR7Q8N806 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBR7Q8N806 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBR7Q8N806 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBR7Q8N806 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBR7Q8N806 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBR7Q8N806 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBR7Q8N806 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBR7Q8N806 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBR7Q8N806 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBR7Q8N806 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBR7Q8N806 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBR7Q8N806 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBR7Q8N806 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
UBR7Q8N806 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBR7Q8N806 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBR7Q8N806 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBR7Q8N806 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBR7Q8N806 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBR7Q8N806 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBR7Q8N806 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBR7Q8N806 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBR7Q8N806 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
UBR7Q8N806 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBR7Q8N806 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBR7Q8N806 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBR7Q8N806 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBR7Q8N806 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBR7Q8N806 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBR7Q8N806 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBR7Q8N806 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBR7Q8N806 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
UBR7Q8N806 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
UBR7Q8N806 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UBR7Q8N806 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
UBR7Q8N806 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBR7Q8N806 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBR7Q8N806 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBR7Q8N806 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBR7Q8N806 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBR7Q8N806 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBR7Q8N806 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBR7Q8N806 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBR7Q8N806 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBR7Q8N806 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBR7Q8N806 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBR7Q8N806 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
UBR7Q8N806 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBR7Q8N806 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBR7Q8N806 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBR7Q8N806 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBR7Q8N806 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
UBR7Q8N806 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBR7Q8N806 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBR7Q8N806 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBR7Q8N806 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
UBR7Q8N806 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBR7Q8N806 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBR7Q8N806 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
UBR7Q8N806 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
UBR7Q8N806 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
UBR7Q8N806 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
UBR7Q8N806 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
UBR7Q8N806 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBR7Q8N806 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBR7Q8N806 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms