Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCSAMQ8N6F7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCSAMQ8N6F7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCSAMQ8N6F7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCSAMQ8N6F7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCSAMQ8N6F7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCSAMQ8N6F7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCSAMQ8N6F7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCSAMQ8N6F7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCSAMQ8N6F7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCSAMQ8N6F7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GCSAMQ8N6F7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCSAMQ8N6F7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCSAMQ8N6F7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCSAMQ8N6F7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCSAMQ8N6F7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GCSAMQ8N6F7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCSAMQ8N6F7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCSAMQ8N6F7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GCSAMQ8N6F7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GCSAMQ8N6F7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GCSAMQ8N6F7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GCSAMQ8N6F7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GCSAMQ8N6F7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCSAMQ8N6F7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCSAMQ8N6F7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCSAMQ8N6F7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCSAMQ8N6F7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCSAMQ8N6F7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCSAMQ8N6F7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCSAMQ8N6F7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GCSAMQ8N6F7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCSAMQ8N6F7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCSAMQ8N6F7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCSAMQ8N6F7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCSAMQ8N6F7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCSAMQ8N6F7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCSAMQ8N6F7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCSAMQ8N6F7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCSAMQ8N6F7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCSAMQ8N6F7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCSAMQ8N6F7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCSAMQ8N6F7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCSAMQ8N6F7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCSAMQ8N6F7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GCSAMQ8N6F7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCSAMQ8N6F7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCSAMQ8N6F7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCSAMQ8N6F7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GCSAMQ8N6F7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GCSAMQ8N6F7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCSAMQ8N6F7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCSAMQ8N6F7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCSAMQ8N6F7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCSAMQ8N6F7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCSAMQ8N6F7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GCSAMQ8N6F7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCSAMQ8N6F7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCSAMQ8N6F7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCSAMQ8N6F7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCSAMQ8N6F7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCSAMQ8N6F7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCSAMQ8N6F7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCSAMQ8N6F7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCSAMQ8N6F7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCSAMQ8N6F7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCSAMQ8N6F7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCSAMQ8N6F7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCSAMQ8N6F7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCSAMQ8N6F7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCSAMQ8N6F7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCSAMQ8N6F7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCSAMQ8N6F7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCSAMQ8N6F7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GCSAMQ8N6F7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GCSAMQ8N6F7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GCSAMQ8N6F7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GCSAMQ8N6F7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GCSAMQ8N6F7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCSAMQ8N6F7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCSAMQ8N6F7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCSAMQ8N6F7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCSAMQ8N6F7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCSAMQ8N6F7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCSAMQ8N6F7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCSAMQ8N6F7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCSAMQ8N6F7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GCSAMQ8N6F7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCSAMQ8N6F7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCSAMQ8N6F7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCSAMQ8N6F7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCSAMQ8N6F7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCSAMQ8N6F7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GCSAMQ8N6F7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GCSAMQ8N6F7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GCSAMQ8N6F7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCSAMQ8N6F7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCSAMQ8N6F7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCSAMQ8N6F7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCSAMQ8N6F7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms