Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5J4

SPIC, Transcription factor Spi-C, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPICQ8N5J4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPICQ8N5J4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPICQ8N5J4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPICQ8N5J4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPICQ8N5J4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPICQ8N5J4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPICQ8N5J4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPICQ8N5J4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPICQ8N5J4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPICQ8N5J4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPICQ8N5J4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPICQ8N5J4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPICQ8N5J4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPICQ8N5J4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPICQ8N5J4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPICQ8N5J4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPICQ8N5J4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SPICQ8N5J4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPICQ8N5J4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPICQ8N5J4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPICQ8N5J4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPICQ8N5J4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SPICQ8N5J4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPICQ8N5J4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SPICQ8N5J4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPICQ8N5J4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPICQ8N5J4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPICQ8N5J4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPICQ8N5J4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPICQ8N5J4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPICQ8N5J4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPICQ8N5J4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPICQ8N5J4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPICQ8N5J4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPICQ8N5J4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPICQ8N5J4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPICQ8N5J4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPICQ8N5J4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPICQ8N5J4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPICQ8N5J4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPICQ8N5J4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPICQ8N5J4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPICQ8N5J4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPICQ8N5J4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SPICQ8N5J4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPICQ8N5J4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPICQ8N5J4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPICQ8N5J4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPICQ8N5J4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPICQ8N5J4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPICQ8N5J4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPICQ8N5J4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPICQ8N5J4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPICQ8N5J4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPICQ8N5J4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPICQ8N5J4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPICQ8N5J4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPICQ8N5J4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPICQ8N5J4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SPICQ8N5J4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPICQ8N5J4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPICQ8N5J4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPICQ8N5J4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPICQ8N5J4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPICQ8N5J4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPICQ8N5J4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPICQ8N5J4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPICQ8N5J4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPICQ8N5J4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPICQ8N5J4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SPICQ8N5J4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPICQ8N5J4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPICQ8N5J4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPICQ8N5J4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPICQ8N5J4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPICQ8N5J4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPICQ8N5J4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPICQ8N5J4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPICQ8N5J4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPICQ8N5J4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPICQ8N5J4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPICQ8N5J4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SPICQ8N5J4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SPICQ8N5J4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPICQ8N5J4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPICQ8N5J4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPICQ8N5J4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPICQ8N5J4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPICQ8N5J4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPICQ8N5J4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPICQ8N5J4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPICQ8N5J4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPICQ8N5J4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPICQ8N5J4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPICQ8N5J4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPICQ8N5J4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPICQ8N5J4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPICQ8N5J4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPICQ8N5J4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPICQ8N5J4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms