Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1W1

ARHGEF28, Rho guanine nucleotide exchange factor 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF28Q8N1W1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
ARHGEF28Q8N1W1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
ARHGEF28Q8N1W1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
ARHGEF28Q8N1W1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
ARHGEF28Q8N1W1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
ARHGEF28Q8N1W1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
ARHGEF28Q8N1W1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
ARHGEF28Q8N1W1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
ARHGEF28Q8N1W1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
ARHGEF28Q8N1W1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ARHGEF28Q8N1W1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ARHGEF28Q8N1W1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ARHGEF28Q8N1W1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ARHGEF28Q8N1W1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
ARHGEF28Q8N1W1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
ARHGEF28Q8N1W1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
ARHGEF28Q8N1W1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
ARHGEF28Q8N1W1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
ARHGEF28Q8N1W1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
ARHGEF28Q8N1W1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
ARHGEF28Q8N1W1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
ARHGEF28Q8N1W1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
ARHGEF28Q8N1W1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
ARHGEF28Q8N1W1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
ARHGEF28Q8N1W1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
ARHGEF28Q8N1W1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
ARHGEF28Q8N1W1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ARHGEF28Q8N1W1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ARHGEF28Q8N1W1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ARHGEF28Q8N1W1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ARHGEF28Q8N1W1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
ARHGEF28Q8N1W1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
ARHGEF28Q8N1W1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ARHGEF28Q8N1W1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
ARHGEF28Q8N1W1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
ARHGEF28Q8N1W1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ARHGEF28Q8N1W1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
ARHGEF28Q8N1W1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ARHGEF28Q8N1W1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36.16■■■■□ 3.38
ARHGEF28Q8N1W1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
ARHGEF28Q8N1W1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
ARHGEF28Q8N1W1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
ARHGEF28Q8N1W1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
ARHGEF28Q8N1W1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC36.14■■■■□ 3.38
ARHGEF28Q8N1W1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
ARHGEF28Q8N1W1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
ARHGEF28Q8N1W1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
ARHGEF28Q8N1W1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
ARHGEF28Q8N1W1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
ARHGEF28Q8N1W1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
ARHGEF28Q8N1W1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
ARHGEF28Q8N1W1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
ARHGEF28Q8N1W1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
ARHGEF28Q8N1W1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
ARHGEF28Q8N1W1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
ARHGEF28Q8N1W1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
ARHGEF28Q8N1W1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
ARHGEF28Q8N1W1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
ARHGEF28Q8N1W1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
ARHGEF28Q8N1W1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
ARHGEF28Q8N1W1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
ARHGEF28Q8N1W1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
ARHGEF28Q8N1W1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
ARHGEF28Q8N1W1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC36.07■■■■□ 3.37
ARHGEF28Q8N1W1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
ARHGEF28Q8N1W1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
ARHGEF28Q8N1W1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
ARHGEF28Q8N1W1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
ARHGEF28Q8N1W1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
ARHGEF28Q8N1W1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
ARHGEF28Q8N1W1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
ARHGEF28Q8N1W1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
ARHGEF28Q8N1W1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
ARHGEF28Q8N1W1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
ARHGEF28Q8N1W1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
ARHGEF28Q8N1W1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
ARHGEF28Q8N1W1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
ARHGEF28Q8N1W1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
ARHGEF28Q8N1W1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ARHGEF28Q8N1W1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ARHGEF28Q8N1W1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
ARHGEF28Q8N1W1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC36.03■■■■□ 3.36
ARHGEF28Q8N1W1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
ARHGEF28Q8N1W1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
ARHGEF28Q8N1W1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
ARHGEF28Q8N1W1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
ARHGEF28Q8N1W1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
ARHGEF28Q8N1W1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
ARHGEF28Q8N1W1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
ARHGEF28Q8N1W1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
ARHGEF28Q8N1W1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
ARHGEF28Q8N1W1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
ARHGEF28Q8N1W1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
ARHGEF28Q8N1W1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
ARHGEF28Q8N1W1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
ARHGEF28Q8N1W1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
ARHGEF28Q8N1W1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
ARHGEF28Q8N1W1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
ARHGEF28Q8N1W1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
ARHGEF28Q8N1W1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
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