Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYA6

CKAP2L, Cytoskeleton-associated protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2LQ8IYA6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CKAP2LQ8IYA6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CKAP2LQ8IYA6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CKAP2LQ8IYA6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CKAP2LQ8IYA6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CKAP2LQ8IYA6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CKAP2LQ8IYA6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CKAP2LQ8IYA6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CKAP2LQ8IYA6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CKAP2LQ8IYA6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CKAP2LQ8IYA6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CKAP2LQ8IYA6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CKAP2LQ8IYA6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CKAP2LQ8IYA6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CKAP2LQ8IYA6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CKAP2LQ8IYA6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CKAP2LQ8IYA6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CKAP2LQ8IYA6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CKAP2LQ8IYA6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CKAP2LQ8IYA6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CKAP2LQ8IYA6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CKAP2LQ8IYA6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CKAP2LQ8IYA6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CKAP2LQ8IYA6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CKAP2LQ8IYA6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CKAP2LQ8IYA6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CKAP2LQ8IYA6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CKAP2LQ8IYA6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CKAP2LQ8IYA6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CKAP2LQ8IYA6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CKAP2LQ8IYA6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CKAP2LQ8IYA6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CKAP2LQ8IYA6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CKAP2LQ8IYA6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CKAP2LQ8IYA6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CKAP2LQ8IYA6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CKAP2LQ8IYA6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CKAP2LQ8IYA6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CKAP2LQ8IYA6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CKAP2LQ8IYA6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CKAP2LQ8IYA6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CKAP2LQ8IYA6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CKAP2LQ8IYA6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CKAP2LQ8IYA6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CKAP2LQ8IYA6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CKAP2LQ8IYA6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CKAP2LQ8IYA6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CKAP2LQ8IYA6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CKAP2LQ8IYA6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CKAP2LQ8IYA6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CKAP2LQ8IYA6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CKAP2LQ8IYA6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CKAP2LQ8IYA6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CKAP2LQ8IYA6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CKAP2LQ8IYA6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CKAP2LQ8IYA6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CKAP2LQ8IYA6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CKAP2LQ8IYA6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CKAP2LQ8IYA6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CKAP2LQ8IYA6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CKAP2LQ8IYA6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CKAP2LQ8IYA6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CKAP2LQ8IYA6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CKAP2LQ8IYA6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CKAP2LQ8IYA6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CKAP2LQ8IYA6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CKAP2LQ8IYA6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CKAP2LQ8IYA6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CKAP2LQ8IYA6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CKAP2LQ8IYA6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CKAP2LQ8IYA6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CKAP2LQ8IYA6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CKAP2LQ8IYA6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CKAP2LQ8IYA6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CKAP2LQ8IYA6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CKAP2LQ8IYA6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CKAP2LQ8IYA6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CKAP2LQ8IYA6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CKAP2LQ8IYA6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CKAP2LQ8IYA6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CKAP2LQ8IYA6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CKAP2LQ8IYA6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CKAP2LQ8IYA6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CKAP2LQ8IYA6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CKAP2LQ8IYA6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CKAP2LQ8IYA6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CKAP2LQ8IYA6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CKAP2LQ8IYA6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CKAP2LQ8IYA6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CKAP2LQ8IYA6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CKAP2LQ8IYA6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CKAP2LQ8IYA6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CKAP2LQ8IYA6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CKAP2LQ8IYA6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CKAP2LQ8IYA6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CKAP2LQ8IYA6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CKAP2LQ8IYA6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CKAP2LQ8IYA6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CKAP2LQ8IYA6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CKAP2LQ8IYA6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms