Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC71Q8IV32 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC71Q8IV32 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC71Q8IV32 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC71Q8IV32 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC71Q8IV32 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC71Q8IV32 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC71Q8IV32 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC71Q8IV32 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC71Q8IV32 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC71Q8IV32 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC71Q8IV32 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC71Q8IV32 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC71Q8IV32 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC71Q8IV32 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC71Q8IV32 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC71Q8IV32 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC71Q8IV32 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC71Q8IV32 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC71Q8IV32 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC71Q8IV32 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC71Q8IV32 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC71Q8IV32 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC71Q8IV32 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC71Q8IV32 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC71Q8IV32 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC71Q8IV32 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC71Q8IV32 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC71Q8IV32 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC71Q8IV32 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC71Q8IV32 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC71Q8IV32 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC71Q8IV32 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC71Q8IV32 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC71Q8IV32 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC71Q8IV32 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC71Q8IV32 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC71Q8IV32 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC71Q8IV32 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC71Q8IV32 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC71Q8IV32 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC71Q8IV32 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC71Q8IV32 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC71Q8IV32 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC71Q8IV32 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC71Q8IV32 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC71Q8IV32 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC71Q8IV32 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC71Q8IV32 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC71Q8IV32 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC71Q8IV32 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC71Q8IV32 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC71Q8IV32 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC71Q8IV32 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC71Q8IV32 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC71Q8IV32 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC71Q8IV32 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC71Q8IV32 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC71Q8IV32 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC71Q8IV32 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC71Q8IV32 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC71Q8IV32 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC71Q8IV32 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC71Q8IV32 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC71Q8IV32 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC71Q8IV32 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC71Q8IV32 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC71Q8IV32 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC71Q8IV32 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC71Q8IV32 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC71Q8IV32 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC71Q8IV32 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC71Q8IV32 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC71Q8IV32 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC71Q8IV32 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC71Q8IV32 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC71Q8IV32 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC71Q8IV32 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC71Q8IV32 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC71Q8IV32 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC71Q8IV32 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC71Q8IV32 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC71Q8IV32 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC71Q8IV32 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC71Q8IV32 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC71Q8IV32 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC71Q8IV32 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC71Q8IV32 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC71Q8IV32 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC71Q8IV32 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC71Q8IV32 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC71Q8IV32 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC71Q8IV32 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC71Q8IV32 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC71Q8IV32 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC71Q8IV32 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC71Q8IV32 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC71Q8IV32 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC71Q8IV32 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC71Q8IV32 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms