Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV13

CCNJL, Cyclin-J-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNJLQ8IV13 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCNJLQ8IV13 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCNJLQ8IV13 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCNJLQ8IV13 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCNJLQ8IV13 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCNJLQ8IV13 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCNJLQ8IV13 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCNJLQ8IV13 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCNJLQ8IV13 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCNJLQ8IV13 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCNJLQ8IV13 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCNJLQ8IV13 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCNJLQ8IV13 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCNJLQ8IV13 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCNJLQ8IV13 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCNJLQ8IV13 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCNJLQ8IV13 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCNJLQ8IV13 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCNJLQ8IV13 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCNJLQ8IV13 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CCNJLQ8IV13 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCNJLQ8IV13 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCNJLQ8IV13 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CCNJLQ8IV13 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCNJLQ8IV13 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCNJLQ8IV13 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCNJLQ8IV13 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCNJLQ8IV13 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCNJLQ8IV13 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCNJLQ8IV13 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCNJLQ8IV13 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCNJLQ8IV13 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCNJLQ8IV13 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCNJLQ8IV13 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCNJLQ8IV13 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCNJLQ8IV13 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCNJLQ8IV13 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCNJLQ8IV13 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCNJLQ8IV13 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCNJLQ8IV13 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCNJLQ8IV13 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCNJLQ8IV13 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCNJLQ8IV13 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCNJLQ8IV13 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCNJLQ8IV13 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCNJLQ8IV13 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCNJLQ8IV13 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCNJLQ8IV13 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
CCNJLQ8IV13 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCNJLQ8IV13 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCNJLQ8IV13 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CCNJLQ8IV13 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCNJLQ8IV13 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCNJLQ8IV13 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCNJLQ8IV13 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNJLQ8IV13 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNJLQ8IV13 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNJLQ8IV13 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNJLQ8IV13 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNJLQ8IV13 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNJLQ8IV13 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNJLQ8IV13 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCNJLQ8IV13 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCNJLQ8IV13 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCNJLQ8IV13 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCNJLQ8IV13 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNJLQ8IV13 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNJLQ8IV13 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNJLQ8IV13 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNJLQ8IV13 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNJLQ8IV13 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNJLQ8IV13 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNJLQ8IV13 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCNJLQ8IV13 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCNJLQ8IV13 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCNJLQ8IV13 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCNJLQ8IV13 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCNJLQ8IV13 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCNJLQ8IV13 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCNJLQ8IV13 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCNJLQ8IV13 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCNJLQ8IV13 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCNJLQ8IV13 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNJLQ8IV13 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNJLQ8IV13 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNJLQ8IV13 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCNJLQ8IV13 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCNJLQ8IV13 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCNJLQ8IV13 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CCNJLQ8IV13 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCNJLQ8IV13 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCNJLQ8IV13 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCNJLQ8IV13 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CCNJLQ8IV13 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCNJLQ8IV13 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCNJLQ8IV13 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCNJLQ8IV13 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCNJLQ8IV13 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CCNJLQ8IV13 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCNJLQ8IV13 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms