Protein–RNA interactions for Protein: Q86YH6

PDSS2, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS2Q86YH6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDSS2Q86YH6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PDSS2Q86YH6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDSS2Q86YH6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDSS2Q86YH6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDSS2Q86YH6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDSS2Q86YH6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PDSS2Q86YH6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDSS2Q86YH6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDSS2Q86YH6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PDSS2Q86YH6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDSS2Q86YH6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDSS2Q86YH6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDSS2Q86YH6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDSS2Q86YH6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDSS2Q86YH6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDSS2Q86YH6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDSS2Q86YH6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDSS2Q86YH6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDSS2Q86YH6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDSS2Q86YH6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDSS2Q86YH6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDSS2Q86YH6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PDSS2Q86YH6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDSS2Q86YH6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDSS2Q86YH6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDSS2Q86YH6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDSS2Q86YH6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDSS2Q86YH6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDSS2Q86YH6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PDSS2Q86YH6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PDSS2Q86YH6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PDSS2Q86YH6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDSS2Q86YH6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDSS2Q86YH6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDSS2Q86YH6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDSS2Q86YH6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDSS2Q86YH6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDSS2Q86YH6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDSS2Q86YH6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDSS2Q86YH6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDSS2Q86YH6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PDSS2Q86YH6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDSS2Q86YH6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PDSS2Q86YH6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDSS2Q86YH6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDSS2Q86YH6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDSS2Q86YH6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDSS2Q86YH6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDSS2Q86YH6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDSS2Q86YH6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDSS2Q86YH6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDSS2Q86YH6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDSS2Q86YH6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDSS2Q86YH6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDSS2Q86YH6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDSS2Q86YH6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDSS2Q86YH6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDSS2Q86YH6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDSS2Q86YH6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDSS2Q86YH6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDSS2Q86YH6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDSS2Q86YH6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDSS2Q86YH6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDSS2Q86YH6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDSS2Q86YH6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDSS2Q86YH6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDSS2Q86YH6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDSS2Q86YH6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDSS2Q86YH6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDSS2Q86YH6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDSS2Q86YH6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDSS2Q86YH6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDSS2Q86YH6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDSS2Q86YH6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDSS2Q86YH6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDSS2Q86YH6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDSS2Q86YH6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDSS2Q86YH6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDSS2Q86YH6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDSS2Q86YH6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDSS2Q86YH6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDSS2Q86YH6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDSS2Q86YH6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDSS2Q86YH6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDSS2Q86YH6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDSS2Q86YH6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDSS2Q86YH6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDSS2Q86YH6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PDSS2Q86YH6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PDSS2Q86YH6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDSS2Q86YH6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDSS2Q86YH6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDSS2Q86YH6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDSS2Q86YH6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDSS2Q86YH6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDSS2Q86YH6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDSS2Q86YH6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDSS2Q86YH6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDSS2Q86YH6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms