Protein–RNA interactions for Protein: Q86YD5

LDLRAD3, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD3Q86YD5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LDLRAD3Q86YD5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LDLRAD3Q86YD5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LDLRAD3Q86YD5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LDLRAD3Q86YD5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LDLRAD3Q86YD5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LDLRAD3Q86YD5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LDLRAD3Q86YD5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LDLRAD3Q86YD5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LDLRAD3Q86YD5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LDLRAD3Q86YD5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LDLRAD3Q86YD5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LDLRAD3Q86YD5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LDLRAD3Q86YD5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LDLRAD3Q86YD5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LDLRAD3Q86YD5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LDLRAD3Q86YD5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LDLRAD3Q86YD5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LDLRAD3Q86YD5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LDLRAD3Q86YD5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LDLRAD3Q86YD5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LDLRAD3Q86YD5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LDLRAD3Q86YD5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LDLRAD3Q86YD5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LDLRAD3Q86YD5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LDLRAD3Q86YD5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LDLRAD3Q86YD5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LDLRAD3Q86YD5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LDLRAD3Q86YD5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LDLRAD3Q86YD5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LDLRAD3Q86YD5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LDLRAD3Q86YD5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LDLRAD3Q86YD5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LDLRAD3Q86YD5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LDLRAD3Q86YD5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LDLRAD3Q86YD5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LDLRAD3Q86YD5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LDLRAD3Q86YD5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LDLRAD3Q86YD5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LDLRAD3Q86YD5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LDLRAD3Q86YD5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LDLRAD3Q86YD5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LDLRAD3Q86YD5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LDLRAD3Q86YD5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LDLRAD3Q86YD5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LDLRAD3Q86YD5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LDLRAD3Q86YD5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LDLRAD3Q86YD5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LDLRAD3Q86YD5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LDLRAD3Q86YD5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LDLRAD3Q86YD5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LDLRAD3Q86YD5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LDLRAD3Q86YD5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LDLRAD3Q86YD5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LDLRAD3Q86YD5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LDLRAD3Q86YD5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LDLRAD3Q86YD5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LDLRAD3Q86YD5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LDLRAD3Q86YD5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
LDLRAD3Q86YD5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LDLRAD3Q86YD5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LDLRAD3Q86YD5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LDLRAD3Q86YD5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LDLRAD3Q86YD5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LDLRAD3Q86YD5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LDLRAD3Q86YD5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LDLRAD3Q86YD5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LDLRAD3Q86YD5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LDLRAD3Q86YD5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LDLRAD3Q86YD5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LDLRAD3Q86YD5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LDLRAD3Q86YD5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LDLRAD3Q86YD5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LDLRAD3Q86YD5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LDLRAD3Q86YD5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LDLRAD3Q86YD5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LDLRAD3Q86YD5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LDLRAD3Q86YD5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LDLRAD3Q86YD5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LDLRAD3Q86YD5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LDLRAD3Q86YD5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LDLRAD3Q86YD5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LDLRAD3Q86YD5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LDLRAD3Q86YD5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LDLRAD3Q86YD5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LDLRAD3Q86YD5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LDLRAD3Q86YD5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LDLRAD3Q86YD5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LDLRAD3Q86YD5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LDLRAD3Q86YD5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LDLRAD3Q86YD5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LDLRAD3Q86YD5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LDLRAD3Q86YD5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LDLRAD3Q86YD5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LDLRAD3Q86YD5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LDLRAD3Q86YD5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LDLRAD3Q86YD5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LDLRAD3Q86YD5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LDLRAD3Q86YD5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LDLRAD3Q86YD5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms