Protein–RNA interactions for Protein: Q86YB7

ECHDC2, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC2Q86YB7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ECHDC2Q86YB7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ECHDC2Q86YB7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ECHDC2Q86YB7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ECHDC2Q86YB7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ECHDC2Q86YB7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
ECHDC2Q86YB7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ECHDC2Q86YB7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ECHDC2Q86YB7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ECHDC2Q86YB7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ECHDC2Q86YB7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ECHDC2Q86YB7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ECHDC2Q86YB7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ECHDC2Q86YB7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ECHDC2Q86YB7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ECHDC2Q86YB7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ECHDC2Q86YB7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ECHDC2Q86YB7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ECHDC2Q86YB7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ECHDC2Q86YB7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ECHDC2Q86YB7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ECHDC2Q86YB7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ECHDC2Q86YB7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ECHDC2Q86YB7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ECHDC2Q86YB7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ECHDC2Q86YB7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ECHDC2Q86YB7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ECHDC2Q86YB7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ECHDC2Q86YB7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ECHDC2Q86YB7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ECHDC2Q86YB7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ECHDC2Q86YB7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ECHDC2Q86YB7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ECHDC2Q86YB7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ECHDC2Q86YB7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ECHDC2Q86YB7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ECHDC2Q86YB7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ECHDC2Q86YB7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
ECHDC2Q86YB7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ECHDC2Q86YB7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ECHDC2Q86YB7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ECHDC2Q86YB7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ECHDC2Q86YB7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ECHDC2Q86YB7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ECHDC2Q86YB7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ECHDC2Q86YB7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ECHDC2Q86YB7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ECHDC2Q86YB7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ECHDC2Q86YB7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ECHDC2Q86YB7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ECHDC2Q86YB7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ECHDC2Q86YB7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ECHDC2Q86YB7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ECHDC2Q86YB7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ECHDC2Q86YB7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
ECHDC2Q86YB7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ECHDC2Q86YB7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ECHDC2Q86YB7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ECHDC2Q86YB7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ECHDC2Q86YB7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ECHDC2Q86YB7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ECHDC2Q86YB7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ECHDC2Q86YB7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ECHDC2Q86YB7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ECHDC2Q86YB7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ECHDC2Q86YB7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ECHDC2Q86YB7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ECHDC2Q86YB7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ECHDC2Q86YB7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ECHDC2Q86YB7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ECHDC2Q86YB7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ECHDC2Q86YB7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ECHDC2Q86YB7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ECHDC2Q86YB7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ECHDC2Q86YB7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ECHDC2Q86YB7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ECHDC2Q86YB7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ECHDC2Q86YB7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ECHDC2Q86YB7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ECHDC2Q86YB7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
ECHDC2Q86YB7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ECHDC2Q86YB7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ECHDC2Q86YB7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ECHDC2Q86YB7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ECHDC2Q86YB7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ECHDC2Q86YB7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ECHDC2Q86YB7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ECHDC2Q86YB7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ECHDC2Q86YB7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ECHDC2Q86YB7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ECHDC2Q86YB7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ECHDC2Q86YB7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ECHDC2Q86YB7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ECHDC2Q86YB7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ECHDC2Q86YB7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ECHDC2Q86YB7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ECHDC2Q86YB7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ECHDC2Q86YB7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ECHDC2Q86YB7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ECHDC2Q86YB7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms