Protein–RNA interactions for Protein: Q86VB7

CD163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163Q86VB7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CD163Q86VB7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD163Q86VB7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD163Q86VB7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD163Q86VB7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD163Q86VB7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD163Q86VB7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD163Q86VB7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD163Q86VB7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD163Q86VB7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD163Q86VB7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD163Q86VB7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD163Q86VB7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD163Q86VB7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD163Q86VB7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD163Q86VB7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD163Q86VB7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD163Q86VB7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD163Q86VB7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD163Q86VB7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD163Q86VB7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD163Q86VB7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD163Q86VB7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD163Q86VB7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD163Q86VB7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD163Q86VB7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD163Q86VB7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD163Q86VB7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD163Q86VB7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD163Q86VB7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD163Q86VB7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD163Q86VB7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD163Q86VB7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD163Q86VB7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD163Q86VB7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD163Q86VB7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD163Q86VB7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD163Q86VB7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD163Q86VB7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD163Q86VB7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD163Q86VB7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD163Q86VB7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD163Q86VB7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD163Q86VB7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD163Q86VB7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD163Q86VB7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD163Q86VB7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD163Q86VB7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CD163Q86VB7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD163Q86VB7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD163Q86VB7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD163Q86VB7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD163Q86VB7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD163Q86VB7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD163Q86VB7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD163Q86VB7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD163Q86VB7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD163Q86VB7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD163Q86VB7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD163Q86VB7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD163Q86VB7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD163Q86VB7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD163Q86VB7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD163Q86VB7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD163Q86VB7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD163Q86VB7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD163Q86VB7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD163Q86VB7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD163Q86VB7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CD163Q86VB7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CD163Q86VB7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD163Q86VB7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD163Q86VB7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD163Q86VB7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD163Q86VB7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD163Q86VB7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CD163Q86VB7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CD163Q86VB7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD163Q86VB7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CD163Q86VB7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CD163Q86VB7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD163Q86VB7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD163Q86VB7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CD163Q86VB7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CD163Q86VB7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD163Q86VB7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD163Q86VB7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD163Q86VB7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD163Q86VB7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD163Q86VB7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD163Q86VB7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD163Q86VB7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD163Q86VB7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD163Q86VB7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD163Q86VB7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CD163Q86VB7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD163Q86VB7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD163Q86VB7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD163Q86VB7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD163Q86VB7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms