Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4H3

HDDC2, HD domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC2Q7Z4H3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDDC2Q7Z4H3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDDC2Q7Z4H3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDDC2Q7Z4H3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDDC2Q7Z4H3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDDC2Q7Z4H3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDDC2Q7Z4H3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDDC2Q7Z4H3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDDC2Q7Z4H3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDDC2Q7Z4H3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDDC2Q7Z4H3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HDDC2Q7Z4H3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDDC2Q7Z4H3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDDC2Q7Z4H3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDDC2Q7Z4H3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDDC2Q7Z4H3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDDC2Q7Z4H3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDDC2Q7Z4H3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDDC2Q7Z4H3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDDC2Q7Z4H3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDDC2Q7Z4H3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDDC2Q7Z4H3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HDDC2Q7Z4H3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDDC2Q7Z4H3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDDC2Q7Z4H3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDDC2Q7Z4H3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HDDC2Q7Z4H3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDDC2Q7Z4H3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDDC2Q7Z4H3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDDC2Q7Z4H3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDDC2Q7Z4H3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDDC2Q7Z4H3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDDC2Q7Z4H3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDDC2Q7Z4H3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDDC2Q7Z4H3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDDC2Q7Z4H3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HDDC2Q7Z4H3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDDC2Q7Z4H3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDDC2Q7Z4H3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDDC2Q7Z4H3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDDC2Q7Z4H3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDDC2Q7Z4H3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDDC2Q7Z4H3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDDC2Q7Z4H3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HDDC2Q7Z4H3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDDC2Q7Z4H3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDDC2Q7Z4H3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDDC2Q7Z4H3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDDC2Q7Z4H3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HDDC2Q7Z4H3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDDC2Q7Z4H3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDDC2Q7Z4H3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDDC2Q7Z4H3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDDC2Q7Z4H3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDDC2Q7Z4H3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDDC2Q7Z4H3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDDC2Q7Z4H3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDDC2Q7Z4H3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDDC2Q7Z4H3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDDC2Q7Z4H3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDDC2Q7Z4H3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDDC2Q7Z4H3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDDC2Q7Z4H3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDDC2Q7Z4H3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDDC2Q7Z4H3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDDC2Q7Z4H3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDDC2Q7Z4H3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDDC2Q7Z4H3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDDC2Q7Z4H3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDDC2Q7Z4H3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDDC2Q7Z4H3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDDC2Q7Z4H3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDDC2Q7Z4H3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDDC2Q7Z4H3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDDC2Q7Z4H3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDDC2Q7Z4H3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HDDC2Q7Z4H3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDDC2Q7Z4H3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDDC2Q7Z4H3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDDC2Q7Z4H3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDDC2Q7Z4H3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDDC2Q7Z4H3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDDC2Q7Z4H3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDDC2Q7Z4H3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HDDC2Q7Z4H3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDDC2Q7Z4H3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDDC2Q7Z4H3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDDC2Q7Z4H3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDDC2Q7Z4H3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HDDC2Q7Z4H3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HDDC2Q7Z4H3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDDC2Q7Z4H3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDDC2Q7Z4H3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDDC2Q7Z4H3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDDC2Q7Z4H3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDDC2Q7Z4H3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDDC2Q7Z4H3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDDC2Q7Z4H3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDDC2Q7Z4H3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDDC2Q7Z4H3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms