Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CACNA2D4Q7Z3S7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CACNA2D4Q7Z3S7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CACNA2D4Q7Z3S7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CACNA2D4Q7Z3S7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CACNA2D4Q7Z3S7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CACNA2D4Q7Z3S7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CACNA2D4Q7Z3S7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CACNA2D4Q7Z3S7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CACNA2D4Q7Z3S7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CACNA2D4Q7Z3S7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CACNA2D4Q7Z3S7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CACNA2D4Q7Z3S7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CACNA2D4Q7Z3S7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CACNA2D4Q7Z3S7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CACNA2D4Q7Z3S7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CACNA2D4Q7Z3S7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CACNA2D4Q7Z3S7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CACNA2D4Q7Z3S7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CACNA2D4Q7Z3S7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CACNA2D4Q7Z3S7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CACNA2D4Q7Z3S7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CACNA2D4Q7Z3S7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CACNA2D4Q7Z3S7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CACNA2D4Q7Z3S7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CACNA2D4Q7Z3S7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CACNA2D4Q7Z3S7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CACNA2D4Q7Z3S7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CACNA2D4Q7Z3S7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CACNA2D4Q7Z3S7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CACNA2D4Q7Z3S7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CACNA2D4Q7Z3S7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CACNA2D4Q7Z3S7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CACNA2D4Q7Z3S7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CACNA2D4Q7Z3S7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CACNA2D4Q7Z3S7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CACNA2D4Q7Z3S7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CACNA2D4Q7Z3S7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CACNA2D4Q7Z3S7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CACNA2D4Q7Z3S7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CACNA2D4Q7Z3S7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CACNA2D4Q7Z3S7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CACNA2D4Q7Z3S7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CACNA2D4Q7Z3S7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CACNA2D4Q7Z3S7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CACNA2D4Q7Z3S7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CACNA2D4Q7Z3S7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CACNA2D4Q7Z3S7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CACNA2D4Q7Z3S7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CACNA2D4Q7Z3S7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CACNA2D4Q7Z3S7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CACNA2D4Q7Z3S7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CACNA2D4Q7Z3S7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CACNA2D4Q7Z3S7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CACNA2D4Q7Z3S7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CACNA2D4Q7Z3S7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CACNA2D4Q7Z3S7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CACNA2D4Q7Z3S7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CACNA2D4Q7Z3S7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CACNA2D4Q7Z3S7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CACNA2D4Q7Z3S7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CACNA2D4Q7Z3S7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CACNA2D4Q7Z3S7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CACNA2D4Q7Z3S7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CACNA2D4Q7Z3S7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CACNA2D4Q7Z3S7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CACNA2D4Q7Z3S7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CACNA2D4Q7Z3S7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CACNA2D4Q7Z3S7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CACNA2D4Q7Z3S7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CACNA2D4Q7Z3S7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CACNA2D4Q7Z3S7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CACNA2D4Q7Z3S7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CACNA2D4Q7Z3S7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CACNA2D4Q7Z3S7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CACNA2D4Q7Z3S7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CACNA2D4Q7Z3S7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CACNA2D4Q7Z3S7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CACNA2D4Q7Z3S7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CACNA2D4Q7Z3S7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CACNA2D4Q7Z3S7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
CACNA2D4Q7Z3S7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CACNA2D4Q7Z3S7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CACNA2D4Q7Z3S7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CACNA2D4Q7Z3S7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CACNA2D4Q7Z3S7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CACNA2D4Q7Z3S7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CACNA2D4Q7Z3S7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CACNA2D4Q7Z3S7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CACNA2D4Q7Z3S7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms