Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
PTF1AQ7RTS3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PTF1AQ7RTS3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PTF1AQ7RTS3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PTF1AQ7RTS3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PTF1AQ7RTS3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PTF1AQ7RTS3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PTF1AQ7RTS3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PTF1AQ7RTS3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PTF1AQ7RTS3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PTF1AQ7RTS3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PTF1AQ7RTS3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PTF1AQ7RTS3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PTF1AQ7RTS3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PTF1AQ7RTS3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PTF1AQ7RTS3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PTF1AQ7RTS3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
PTF1AQ7RTS3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PTF1AQ7RTS3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PTF1AQ7RTS3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PTF1AQ7RTS3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PTF1AQ7RTS3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PTF1AQ7RTS3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PTF1AQ7RTS3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PTF1AQ7RTS3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PTF1AQ7RTS3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PTF1AQ7RTS3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PTF1AQ7RTS3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PTF1AQ7RTS3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PTF1AQ7RTS3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
PTF1AQ7RTS3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PTF1AQ7RTS3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
PTF1AQ7RTS3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PTF1AQ7RTS3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC33.82■■■■□ 3
PTF1AQ7RTS3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PTF1AQ7RTS3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PTF1AQ7RTS3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
PTF1AQ7RTS3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
PTF1AQ7RTS3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
PTF1AQ7RTS3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PTF1AQ7RTS3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC33.8■■■■□ 3
PTF1AQ7RTS3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PTF1AQ7RTS3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
PTF1AQ7RTS3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PTF1AQ7RTS3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC33.78■■■■□ 3
PTF1AQ7RTS3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PTF1AQ7RTS3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
PTF1AQ7RTS3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PTF1AQ7RTS3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
PTF1AQ7RTS3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PTF1AQ7RTS3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
PTF1AQ7RTS3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PTF1AQ7RTS3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PTF1AQ7RTS3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PTF1AQ7RTS3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PTF1AQ7RTS3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PTF1AQ7RTS3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PTF1AQ7RTS3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PTF1AQ7RTS3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PTF1AQ7RTS3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PTF1AQ7RTS3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PTF1AQ7RTS3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PTF1AQ7RTS3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PTF1AQ7RTS3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PTF1AQ7RTS3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PTF1AQ7RTS3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
PTF1AQ7RTS3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PTF1AQ7RTS3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PTF1AQ7RTS3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PTF1AQ7RTS3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PTF1AQ7RTS3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PTF1AQ7RTS3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
PTF1AQ7RTS3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PTF1AQ7RTS3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
PTF1AQ7RTS3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PTF1AQ7RTS3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PTF1AQ7RTS3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PTF1AQ7RTS3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PTF1AQ7RTS3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PTF1AQ7RTS3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PTF1AQ7RTS3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PTF1AQ7RTS3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
PTF1AQ7RTS3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PTF1AQ7RTS3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PTF1AQ7RTS3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
PTF1AQ7RTS3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PTF1AQ7RTS3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
PTF1AQ7RTS3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PTF1AQ7RTS3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PTF1AQ7RTS3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PTF1AQ7RTS3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PTF1AQ7RTS3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
PTF1AQ7RTS3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PTF1AQ7RTS3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PTF1AQ7RTS3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PTF1AQ7RTS3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
PTF1AQ7RTS3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PTF1AQ7RTS3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PTF1AQ7RTS3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PTF1AQ7RTS3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms