Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
OTOP1Q7RTM1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
OTOP1Q7RTM1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
OTOP1Q7RTM1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
OTOP1Q7RTM1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
OTOP1Q7RTM1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
OTOP1Q7RTM1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
OTOP1Q7RTM1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
OTOP1Q7RTM1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
OTOP1Q7RTM1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
OTOP1Q7RTM1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
OTOP1Q7RTM1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
OTOP1Q7RTM1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
OTOP1Q7RTM1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
OTOP1Q7RTM1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
OTOP1Q7RTM1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
OTOP1Q7RTM1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
OTOP1Q7RTM1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
OTOP1Q7RTM1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
OTOP1Q7RTM1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
OTOP1Q7RTM1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
OTOP1Q7RTM1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
OTOP1Q7RTM1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
OTOP1Q7RTM1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
OTOP1Q7RTM1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
OTOP1Q7RTM1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
OTOP1Q7RTM1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
OTOP1Q7RTM1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
OTOP1Q7RTM1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
OTOP1Q7RTM1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
OTOP1Q7RTM1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
OTOP1Q7RTM1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
OTOP1Q7RTM1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
OTOP1Q7RTM1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
OTOP1Q7RTM1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
OTOP1Q7RTM1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
OTOP1Q7RTM1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
OTOP1Q7RTM1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
OTOP1Q7RTM1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
OTOP1Q7RTM1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
OTOP1Q7RTM1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
OTOP1Q7RTM1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
OTOP1Q7RTM1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
OTOP1Q7RTM1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
OTOP1Q7RTM1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
OTOP1Q7RTM1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
OTOP1Q7RTM1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
OTOP1Q7RTM1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
OTOP1Q7RTM1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
OTOP1Q7RTM1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
OTOP1Q7RTM1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
OTOP1Q7RTM1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
OTOP1Q7RTM1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
OTOP1Q7RTM1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
OTOP1Q7RTM1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
OTOP1Q7RTM1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
OTOP1Q7RTM1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
OTOP1Q7RTM1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
OTOP1Q7RTM1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
OTOP1Q7RTM1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
OTOP1Q7RTM1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
OTOP1Q7RTM1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
OTOP1Q7RTM1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
OTOP1Q7RTM1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
OTOP1Q7RTM1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
OTOP1Q7RTM1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
OTOP1Q7RTM1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
OTOP1Q7RTM1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
OTOP1Q7RTM1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
OTOP1Q7RTM1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
OTOP1Q7RTM1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
OTOP1Q7RTM1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
OTOP1Q7RTM1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
OTOP1Q7RTM1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
OTOP1Q7RTM1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
OTOP1Q7RTM1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
OTOP1Q7RTM1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
OTOP1Q7RTM1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
OTOP1Q7RTM1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
OTOP1Q7RTM1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
OTOP1Q7RTM1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
OTOP1Q7RTM1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
OTOP1Q7RTM1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
OTOP1Q7RTM1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
OTOP1Q7RTM1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
OTOP1Q7RTM1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
OTOP1Q7RTM1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
OTOP1Q7RTM1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
OTOP1Q7RTM1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
OTOP1Q7RTM1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
OTOP1Q7RTM1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
OTOP1Q7RTM1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
OTOP1Q7RTM1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
OTOP1Q7RTM1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
OTOP1Q7RTM1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
OTOP1Q7RTM1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
OTOP1Q7RTM1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
OTOP1Q7RTM1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
OTOP1Q7RTM1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
OTOP1Q7RTM1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms